Protein–RNA interactions for Protein: Q62231

Six1, Homeobox protein SIX1, mousemouse

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Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six1Q62231 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Six1Q62231 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Six1Q62231 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Six1Q62231 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Six1Q62231 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Six1Q62231 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Six1Q62231 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Six1Q62231 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Six1Q62231 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Six1Q62231 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Six1Q62231 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Six1Q62231 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Six1Q62231 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Six1Q62231 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Six1Q62231 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Six1Q62231 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Six1Q62231 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Six1Q62231 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Six1Q62231 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Six1Q62231 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Six1Q62231 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Six1Q62231 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Six1Q62231 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Six1Q62231 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Six1Q62231 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Six1Q62231 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Six1Q62231 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Six1Q62231 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Six1Q62231 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Six1Q62231 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Six1Q62231 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Six1Q62231 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Six1Q62231 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Six1Q62231 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Six1Q62231 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Six1Q62231 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Six1Q62231 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Six1Q62231 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Six1Q62231 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Six1Q62231 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Six1Q62231 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Six1Q62231 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Six1Q62231 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Six1Q62231 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Six1Q62231 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Six1Q62231 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Six1Q62231 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Six1Q62231 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Six1Q62231 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Six1Q62231 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Six1Q62231 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Six1Q62231 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Six1Q62231 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Six1Q62231 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Six1Q62231 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Six1Q62231 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Six1Q62231 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Six1Q62231 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Six1Q62231 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Six1Q62231 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Six1Q62231 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Six1Q62231 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Six1Q62231 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Six1Q62231 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Six1Q62231 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Six1Q62231 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Six1Q62231 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Six1Q62231 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Six1Q62231 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Six1Q62231 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Six1Q62231 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Six1Q62231 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Six1Q62231 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Six1Q62231 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Six1Q62231 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Six1Q62231 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Six1Q62231 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Six1Q62231 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Six1Q62231 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Six1Q62231 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Six1Q62231 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Six1Q62231 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Six1Q62231 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Six1Q62231 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Six1Q62231 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Six1Q62231 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Six1Q62231 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Six1Q62231 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Six1Q62231 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Six1Q62231 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Six1Q62231 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Six1Q62231 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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