Protein–RNA interactions for Protein: Q62209

Sycp1, Synaptonemal complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp1Q62209 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sycp1Q62209 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sycp1Q62209 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sycp1Q62209 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sycp1Q62209 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sycp1Q62209 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Sycp1Q62209 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Sycp1Q62209 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Sycp1Q62209 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Sycp1Q62209 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sycp1Q62209 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sycp1Q62209 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sycp1Q62209 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sycp1Q62209 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sycp1Q62209 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sycp1Q62209 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sycp1Q62209 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sycp1Q62209 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sycp1Q62209 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sycp1Q62209 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sycp1Q62209 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sycp1Q62209 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sycp1Q62209 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sycp1Q62209 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sycp1Q62209 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sycp1Q62209 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Sycp1Q62209 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sycp1Q62209 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sycp1Q62209 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sycp1Q62209 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sycp1Q62209 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sycp1Q62209 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sycp1Q62209 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sycp1Q62209 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sycp1Q62209 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sycp1Q62209 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sycp1Q62209 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sycp1Q62209 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sycp1Q62209 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sycp1Q62209 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sycp1Q62209 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sycp1Q62209 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sycp1Q62209 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sycp1Q62209 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sycp1Q62209 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sycp1Q62209 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sycp1Q62209 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sycp1Q62209 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sycp1Q62209 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sycp1Q62209 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Sycp1Q62209 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sycp1Q62209 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sycp1Q62209 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sycp1Q62209 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sycp1Q62209 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sycp1Q62209 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sycp1Q62209 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sycp1Q62209 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sycp1Q62209 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sycp1Q62209 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sycp1Q62209 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sycp1Q62209 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sycp1Q62209 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sycp1Q62209 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sycp1Q62209 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sycp1Q62209 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sycp1Q62209 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sycp1Q62209 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sycp1Q62209 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sycp1Q62209 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Sycp1Q62209 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sycp1Q62209 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sycp1Q62209 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sycp1Q62209 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sycp1Q62209 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sycp1Q62209 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sycp1Q62209 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sycp1Q62209 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sycp1Q62209 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sycp1Q62209 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sycp1Q62209 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sycp1Q62209 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sycp1Q62209 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sycp1Q62209 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sycp1Q62209 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sycp1Q62209 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sycp1Q62209 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sycp1Q62209 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sycp1Q62209 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sycp1Q62209 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sycp1Q62209 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sycp1Q62209 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sycp1Q62209 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Sycp1Q62209 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Sycp1Q62209 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Sycp1Q62209 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Sycp1Q62209 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Sycp1Q62209 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Sycp1Q62209 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sycp1Q62209 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms