Protein–RNA interactions for Protein: Q62189

Snrpa, U1 small nuclear ribonucleoprotein A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpaQ62189 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SnrpaQ62189 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SnrpaQ62189 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SnrpaQ62189 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SnrpaQ62189 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SnrpaQ62189 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SnrpaQ62189 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SnrpaQ62189 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SnrpaQ62189 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SnrpaQ62189 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SnrpaQ62189 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SnrpaQ62189 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SnrpaQ62189 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SnrpaQ62189 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SnrpaQ62189 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SnrpaQ62189 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SnrpaQ62189 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SnrpaQ62189 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SnrpaQ62189 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SnrpaQ62189 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SnrpaQ62189 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SnrpaQ62189 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SnrpaQ62189 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SnrpaQ62189 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SnrpaQ62189 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SnrpaQ62189 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SnrpaQ62189 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SnrpaQ62189 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SnrpaQ62189 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SnrpaQ62189 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SnrpaQ62189 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SnrpaQ62189 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SnrpaQ62189 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SnrpaQ62189 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SnrpaQ62189 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SnrpaQ62189 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SnrpaQ62189 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SnrpaQ62189 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SnrpaQ62189 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SnrpaQ62189 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SnrpaQ62189 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SnrpaQ62189 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SnrpaQ62189 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SnrpaQ62189 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SnrpaQ62189 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SnrpaQ62189 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SnrpaQ62189 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SnrpaQ62189 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SnrpaQ62189 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SnrpaQ62189 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SnrpaQ62189 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SnrpaQ62189 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SnrpaQ62189 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SnrpaQ62189 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SnrpaQ62189 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SnrpaQ62189 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SnrpaQ62189 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SnrpaQ62189 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SnrpaQ62189 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SnrpaQ62189 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SnrpaQ62189 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SnrpaQ62189 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SnrpaQ62189 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SnrpaQ62189 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SnrpaQ62189 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SnrpaQ62189 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SnrpaQ62189 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SnrpaQ62189 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SnrpaQ62189 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SnrpaQ62189 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SnrpaQ62189 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SnrpaQ62189 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SnrpaQ62189 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SnrpaQ62189 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SnrpaQ62189 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SnrpaQ62189 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SnrpaQ62189 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SnrpaQ62189 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SnrpaQ62189 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SnrpaQ62189 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SnrpaQ62189 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SnrpaQ62189 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SnrpaQ62189 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SnrpaQ62189 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SnrpaQ62189 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SnrpaQ62189 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SnrpaQ62189 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SnrpaQ62189 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SnrpaQ62189 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SnrpaQ62189 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SnrpaQ62189 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SnrpaQ62189 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SnrpaQ62189 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SnrpaQ62189 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SnrpaQ62189 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SnrpaQ62189 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SnrpaQ62189 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SnrpaQ62189 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SnrpaQ62189 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SnrpaQ62189 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms