Protein–RNA interactions for Protein: Q62186

Ssr4, Translocon-associated protein subunit delta, mousemouse

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Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssr4Q62186 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ssr4Q62186 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ssr4Q62186 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ssr4Q62186 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ssr4Q62186 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ssr4Q62186 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ssr4Q62186 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ssr4Q62186 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ssr4Q62186 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ssr4Q62186 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ssr4Q62186 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ssr4Q62186 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ssr4Q62186 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ssr4Q62186 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ssr4Q62186 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ssr4Q62186 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ssr4Q62186 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ssr4Q62186 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ssr4Q62186 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ssr4Q62186 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ssr4Q62186 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ssr4Q62186 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ssr4Q62186 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ssr4Q62186 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ssr4Q62186 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ssr4Q62186 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ssr4Q62186 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ssr4Q62186 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ssr4Q62186 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ssr4Q62186 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ssr4Q62186 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ssr4Q62186 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ssr4Q62186 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ssr4Q62186 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ssr4Q62186 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ssr4Q62186 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ssr4Q62186 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ssr4Q62186 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ssr4Q62186 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ssr4Q62186 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ssr4Q62186 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ssr4Q62186 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ssr4Q62186 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ssr4Q62186 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ssr4Q62186 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ssr4Q62186 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ssr4Q62186 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ssr4Q62186 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ssr4Q62186 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ssr4Q62186 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ssr4Q62186 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ssr4Q62186 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ssr4Q62186 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ssr4Q62186 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ssr4Q62186 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ssr4Q62186 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ssr4Q62186 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ssr4Q62186 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ssr4Q62186 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ssr4Q62186 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ssr4Q62186 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Ssr4Q62186 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Ssr4Q62186 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ssr4Q62186 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ssr4Q62186 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ssr4Q62186 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ssr4Q62186 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ssr4Q62186 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Ssr4Q62186 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ssr4Q62186 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ssr4Q62186 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ssr4Q62186 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ssr4Q62186 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ssr4Q62186 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ssr4Q62186 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ssr4Q62186 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ssr4Q62186 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ssr4Q62186 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ssr4Q62186 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ssr4Q62186 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ssr4Q62186 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ssr4Q62186 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ssr4Q62186 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ssr4Q62186 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ssr4Q62186 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ssr4Q62186 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ssr4Q62186 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ssr4Q62186 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ssr4Q62186 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ssr4Q62186 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ssr4Q62186 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ssr4Q62186 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ssr4Q62186 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms