Protein–RNA interactions for Protein: Q62181

Sema3c, Semaphorin-3C, mousemouse

Predictions only

Length 751 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3cQ62181 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sema3cQ62181 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sema3cQ62181 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sema3cQ62181 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sema3cQ62181 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sema3cQ62181 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sema3cQ62181 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sema3cQ62181 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sema3cQ62181 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sema3cQ62181 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sema3cQ62181 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sema3cQ62181 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sema3cQ62181 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sema3cQ62181 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sema3cQ62181 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sema3cQ62181 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sema3cQ62181 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sema3cQ62181 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sema3cQ62181 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sema3cQ62181 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sema3cQ62181 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sema3cQ62181 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sema3cQ62181 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sema3cQ62181 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sema3cQ62181 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sema3cQ62181 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sema3cQ62181 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sema3cQ62181 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sema3cQ62181 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sema3cQ62181 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sema3cQ62181 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sema3cQ62181 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sema3cQ62181 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sema3cQ62181 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sema3cQ62181 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sema3cQ62181 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sema3cQ62181 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sema3cQ62181 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sema3cQ62181 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sema3cQ62181 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sema3cQ62181 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sema3cQ62181 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sema3cQ62181 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sema3cQ62181 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sema3cQ62181 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sema3cQ62181 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sema3cQ62181 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sema3cQ62181 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sema3cQ62181 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sema3cQ62181 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sema3cQ62181 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sema3cQ62181 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sema3cQ62181 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sema3cQ62181 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sema3cQ62181 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sema3cQ62181 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sema3cQ62181 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sema3cQ62181 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sema3cQ62181 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sema3cQ62181 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sema3cQ62181 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sema3cQ62181 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sema3cQ62181 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sema3cQ62181 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sema3cQ62181 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sema3cQ62181 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sema3cQ62181 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Sema3cQ62181 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sema3cQ62181 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sema3cQ62181 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sema3cQ62181 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sema3cQ62181 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sema3cQ62181 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sema3cQ62181 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sema3cQ62181 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sema3cQ62181 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sema3cQ62181 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sema3cQ62181 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sema3cQ62181 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sema3cQ62181 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sema3cQ62181 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sema3cQ62181 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sema3cQ62181 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sema3cQ62181 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sema3cQ62181 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sema3cQ62181 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sema3cQ62181 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sema3cQ62181 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sema3cQ62181 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sema3cQ62181 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema3cQ62181 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema3cQ62181 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema3cQ62181 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema3cQ62181 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema3cQ62181 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema3cQ62181 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema3cQ62181 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema3cQ62181 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema3cQ62181 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms