Protein–RNA interactions for Protein: Q62176

Rbm38, RNA-binding protein 38, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm38Q62176 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rbm38Q62176 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rbm38Q62176 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rbm38Q62176 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rbm38Q62176 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rbm38Q62176 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rbm38Q62176 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rbm38Q62176 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rbm38Q62176 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rbm38Q62176 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rbm38Q62176 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rbm38Q62176 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rbm38Q62176 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rbm38Q62176 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rbm38Q62176 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rbm38Q62176 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rbm38Q62176 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rbm38Q62176 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rbm38Q62176 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rbm38Q62176 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Rbm38Q62176 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rbm38Q62176 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Rbm38Q62176 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rbm38Q62176 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Rbm38Q62176 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rbm38Q62176 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rbm38Q62176 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rbm38Q62176 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rbm38Q62176 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rbm38Q62176 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rbm38Q62176 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rbm38Q62176 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rbm38Q62176 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rbm38Q62176 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rbm38Q62176 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rbm38Q62176 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rbm38Q62176 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Rbm38Q62176 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rbm38Q62176 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Rbm38Q62176 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rbm38Q62176 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rbm38Q62176 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Rbm38Q62176 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rbm38Q62176 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rbm38Q62176 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rbm38Q62176 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rbm38Q62176 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rbm38Q62176 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rbm38Q62176 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rbm38Q62176 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rbm38Q62176 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rbm38Q62176 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rbm38Q62176 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rbm38Q62176 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rbm38Q62176 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rbm38Q62176 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rbm38Q62176 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rbm38Q62176 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
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Rbm38Q62176 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rbm38Q62176 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rbm38Q62176 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rbm38Q62176 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rbm38Q62176 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rbm38Q62176 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Rbm38Q62176 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Rbm38Q62176 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rbm38Q62176 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rbm38Q62176 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Rbm38Q62176 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rbm38Q62176 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rbm38Q62176 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rbm38Q62176 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rbm38Q62176 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rbm38Q62176 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rbm38Q62176 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rbm38Q62176 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rbm38Q62176 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rbm38Q62176 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rbm38Q62176 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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