Protein–RNA interactions for Protein: Q61481

Pde1a, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1A, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1aQ61481 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pde1aQ61481 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pde1aQ61481 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pde1aQ61481 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pde1aQ61481 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pde1aQ61481 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pde1aQ61481 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pde1aQ61481 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pde1aQ61481 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pde1aQ61481 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pde1aQ61481 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pde1aQ61481 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pde1aQ61481 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pde1aQ61481 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pde1aQ61481 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pde1aQ61481 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pde1aQ61481 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pde1aQ61481 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pde1aQ61481 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pde1aQ61481 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pde1aQ61481 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pde1aQ61481 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pde1aQ61481 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pde1aQ61481 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pde1aQ61481 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pde1aQ61481 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pde1aQ61481 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pde1aQ61481 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pde1aQ61481 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pde1aQ61481 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pde1aQ61481 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pde1aQ61481 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pde1aQ61481 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pde1aQ61481 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pde1aQ61481 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pde1aQ61481 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pde1aQ61481 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pde1aQ61481 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pde1aQ61481 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pde1aQ61481 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pde1aQ61481 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pde1aQ61481 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pde1aQ61481 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pde1aQ61481 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pde1aQ61481 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pde1aQ61481 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pde1aQ61481 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pde1aQ61481 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pde1aQ61481 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pde1aQ61481 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pde1aQ61481 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pde1aQ61481 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pde1aQ61481 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pde1aQ61481 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pde1aQ61481 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pde1aQ61481 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pde1aQ61481 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pde1aQ61481 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pde1aQ61481 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pde1aQ61481 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pde1aQ61481 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pde1aQ61481 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pde1aQ61481 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pde1aQ61481 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pde1aQ61481 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pde1aQ61481 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pde1aQ61481 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pde1aQ61481 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pde1aQ61481 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pde1aQ61481 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pde1aQ61481 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pde1aQ61481 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pde1aQ61481 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pde1aQ61481 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pde1aQ61481 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pde1aQ61481 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pde1aQ61481 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pde1aQ61481 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pde1aQ61481 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pde1aQ61481 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pde1aQ61481 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pde1aQ61481 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pde1aQ61481 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pde1aQ61481 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pde1aQ61481 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pde1aQ61481 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pde1aQ61481 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pde1aQ61481 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pde1aQ61481 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pde1aQ61481 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pde1aQ61481 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pde1aQ61481 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pde1aQ61481 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pde1aQ61481 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pde1aQ61481 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pde1aQ61481 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pde1aQ61481 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pde1aQ61481 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pde1aQ61481 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pde1aQ61481 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms