Protein–RNA interactions for Protein: Q61466

Smarcd1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcd1Q61466 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smarcd1Q61466 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smarcd1Q61466 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smarcd1Q61466 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smarcd1Q61466 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smarcd1Q61466 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smarcd1Q61466 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smarcd1Q61466 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smarcd1Q61466 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smarcd1Q61466 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Smarcd1Q61466 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smarcd1Q61466 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smarcd1Q61466 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smarcd1Q61466 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smarcd1Q61466 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smarcd1Q61466 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smarcd1Q61466 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smarcd1Q61466 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smarcd1Q61466 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smarcd1Q61466 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smarcd1Q61466 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smarcd1Q61466 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smarcd1Q61466 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smarcd1Q61466 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smarcd1Q61466 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smarcd1Q61466 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smarcd1Q61466 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smarcd1Q61466 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smarcd1Q61466 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smarcd1Q61466 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smarcd1Q61466 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smarcd1Q61466 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smarcd1Q61466 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smarcd1Q61466 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smarcd1Q61466 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smarcd1Q61466 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smarcd1Q61466 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smarcd1Q61466 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smarcd1Q61466 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smarcd1Q61466 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smarcd1Q61466 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Smarcd1Q61466 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smarcd1Q61466 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smarcd1Q61466 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smarcd1Q61466 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smarcd1Q61466 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smarcd1Q61466 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smarcd1Q61466 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smarcd1Q61466 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smarcd1Q61466 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smarcd1Q61466 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smarcd1Q61466 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smarcd1Q61466 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smarcd1Q61466 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smarcd1Q61466 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smarcd1Q61466 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smarcd1Q61466 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smarcd1Q61466 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smarcd1Q61466 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smarcd1Q61466 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smarcd1Q61466 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smarcd1Q61466 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smarcd1Q61466 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smarcd1Q61466 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smarcd1Q61466 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smarcd1Q61466 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smarcd1Q61466 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smarcd1Q61466 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smarcd1Q61466 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smarcd1Q61466 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smarcd1Q61466 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smarcd1Q61466 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smarcd1Q61466 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smarcd1Q61466 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smarcd1Q61466 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smarcd1Q61466 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smarcd1Q61466 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smarcd1Q61466 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smarcd1Q61466 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smarcd1Q61466 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smarcd1Q61466 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smarcd1Q61466 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smarcd1Q61466 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Smarcd1Q61466 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smarcd1Q61466 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smarcd1Q61466 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smarcd1Q61466 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smarcd1Q61466 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smarcd1Q61466 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smarcd1Q61466 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smarcd1Q61466 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smarcd1Q61466 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smarcd1Q61466 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smarcd1Q61466 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Smarcd1Q61466 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smarcd1Q61466 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smarcd1Q61466 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Smarcd1Q61466 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smarcd1Q61466 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smarcd1Q61466 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms