Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PcolceQ61398 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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PcolceQ61398 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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PcolceQ61398 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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PcolceQ61398 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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PcolceQ61398 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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