Protein–RNA interactions for Protein: Q61285

Abcd2, ATP-binding cassette sub-family D member 2, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd2Q61285 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abcd2Q61285 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abcd2Q61285 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abcd2Q61285 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abcd2Q61285 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abcd2Q61285 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Abcd2Q61285 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Abcd2Q61285 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Abcd2Q61285 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Abcd2Q61285 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Abcd2Q61285 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Abcd2Q61285 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Abcd2Q61285 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Abcd2Q61285 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Abcd2Q61285 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Abcd2Q61285 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Abcd2Q61285 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Abcd2Q61285 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Abcd2Q61285 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Abcd2Q61285 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Abcd2Q61285 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Abcd2Q61285 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Abcd2Q61285 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Abcd2Q61285 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Abcd2Q61285 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Abcd2Q61285 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Abcd2Q61285 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Abcd2Q61285 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Abcd2Q61285 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Abcd2Q61285 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Abcd2Q61285 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Abcd2Q61285 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Abcd2Q61285 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Abcd2Q61285 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Abcd2Q61285 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Abcd2Q61285 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Abcd2Q61285 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Abcd2Q61285 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Abcd2Q61285 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Abcd2Q61285 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Abcd2Q61285 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Abcd2Q61285 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Abcd2Q61285 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Abcd2Q61285 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Abcd2Q61285 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Abcd2Q61285 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Abcd2Q61285 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Abcd2Q61285 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Abcd2Q61285 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Abcd2Q61285 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Abcd2Q61285 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Abcd2Q61285 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Abcd2Q61285 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Abcd2Q61285 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Abcd2Q61285 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Abcd2Q61285 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Abcd2Q61285 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Abcd2Q61285 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Abcd2Q61285 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Abcd2Q61285 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Abcd2Q61285 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Abcd2Q61285 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Abcd2Q61285 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Abcd2Q61285 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Abcd2Q61285 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Abcd2Q61285 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms