Protein–RNA interactions for Protein: Q61009

Scarb1, Scavenger receptor class B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarb1Q61009 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Scarb1Q61009 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Scarb1Q61009 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Scarb1Q61009 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Scarb1Q61009 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Scarb1Q61009 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Scarb1Q61009 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Scarb1Q61009 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Scarb1Q61009 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Scarb1Q61009 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Scarb1Q61009 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Scarb1Q61009 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Scarb1Q61009 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Scarb1Q61009 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Scarb1Q61009 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Scarb1Q61009 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Scarb1Q61009 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Scarb1Q61009 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Scarb1Q61009 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Scarb1Q61009 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Scarb1Q61009 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Scarb1Q61009 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Scarb1Q61009 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Scarb1Q61009 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Scarb1Q61009 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Scarb1Q61009 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Scarb1Q61009 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Scarb1Q61009 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Scarb1Q61009 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Scarb1Q61009 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Scarb1Q61009 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Scarb1Q61009 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Scarb1Q61009 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Scarb1Q61009 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Scarb1Q61009 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Scarb1Q61009 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Scarb1Q61009 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Scarb1Q61009 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Scarb1Q61009 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Scarb1Q61009 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Scarb1Q61009 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Scarb1Q61009 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Scarb1Q61009 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Scarb1Q61009 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Scarb1Q61009 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Scarb1Q61009 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Scarb1Q61009 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Scarb1Q61009 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Scarb1Q61009 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Scarb1Q61009 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Scarb1Q61009 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Scarb1Q61009 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Scarb1Q61009 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Scarb1Q61009 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Scarb1Q61009 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Scarb1Q61009 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Scarb1Q61009 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Scarb1Q61009 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Scarb1Q61009 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Scarb1Q61009 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Scarb1Q61009 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Scarb1Q61009 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Scarb1Q61009 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Scarb1Q61009 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Scarb1Q61009 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Scarb1Q61009 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Scarb1Q61009 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Scarb1Q61009 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Scarb1Q61009 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Scarb1Q61009 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Scarb1Q61009 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Scarb1Q61009 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Scarb1Q61009 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Scarb1Q61009 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Scarb1Q61009 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Scarb1Q61009 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Scarb1Q61009 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Scarb1Q61009 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Scarb1Q61009 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Scarb1Q61009 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Scarb1Q61009 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Scarb1Q61009 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Scarb1Q61009 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Scarb1Q61009 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Scarb1Q61009 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Scarb1Q61009 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Scarb1Q61009 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Scarb1Q61009 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Scarb1Q61009 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Scarb1Q61009 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Scarb1Q61009 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Scarb1Q61009 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Scarb1Q61009 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Scarb1Q61009 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Scarb1Q61009 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Scarb1Q61009 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Scarb1Q61009 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Scarb1Q61009 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Scarb1Q61009 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Scarb1Q61009 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms