Protein–RNA interactions for Protein: Q60809

Cnot7, CCR4-NOT transcription complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot7Q60809 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cnot7Q60809 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cnot7Q60809 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cnot7Q60809 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cnot7Q60809 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Cnot7Q60809 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cnot7Q60809 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cnot7Q60809 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cnot7Q60809 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cnot7Q60809 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cnot7Q60809 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cnot7Q60809 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cnot7Q60809 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cnot7Q60809 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cnot7Q60809 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cnot7Q60809 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cnot7Q60809 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cnot7Q60809 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cnot7Q60809 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cnot7Q60809 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cnot7Q60809 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cnot7Q60809 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cnot7Q60809 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cnot7Q60809 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cnot7Q60809 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cnot7Q60809 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cnot7Q60809 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cnot7Q60809 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cnot7Q60809 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cnot7Q60809 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cnot7Q60809 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cnot7Q60809 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cnot7Q60809 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cnot7Q60809 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cnot7Q60809 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cnot7Q60809 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cnot7Q60809 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cnot7Q60809 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cnot7Q60809 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cnot7Q60809 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cnot7Q60809 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cnot7Q60809 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cnot7Q60809 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cnot7Q60809 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cnot7Q60809 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cnot7Q60809 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cnot7Q60809 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cnot7Q60809 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cnot7Q60809 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cnot7Q60809 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cnot7Q60809 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cnot7Q60809 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cnot7Q60809 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cnot7Q60809 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cnot7Q60809 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cnot7Q60809 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cnot7Q60809 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cnot7Q60809 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cnot7Q60809 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cnot7Q60809 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cnot7Q60809 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cnot7Q60809 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cnot7Q60809 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cnot7Q60809 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cnot7Q60809 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cnot7Q60809 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cnot7Q60809 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cnot7Q60809 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cnot7Q60809 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cnot7Q60809 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cnot7Q60809 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cnot7Q60809 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cnot7Q60809 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cnot7Q60809 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cnot7Q60809 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cnot7Q60809 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cnot7Q60809 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cnot7Q60809 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cnot7Q60809 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cnot7Q60809 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cnot7Q60809 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cnot7Q60809 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cnot7Q60809 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Cnot7Q60809 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cnot7Q60809 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Cnot7Q60809 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Cnot7Q60809 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cnot7Q60809 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cnot7Q60809 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cnot7Q60809 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cnot7Q60809 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cnot7Q60809 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cnot7Q60809 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cnot7Q60809 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cnot7Q60809 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cnot7Q60809 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cnot7Q60809 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cnot7Q60809 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cnot7Q60809 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cnot7Q60809 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms