Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Traf3Q60803 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Traf3Q60803 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Traf3Q60803 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Traf3Q60803 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Traf3Q60803 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Traf3Q60803 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Traf3Q60803 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Traf3Q60803 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Traf3Q60803 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Traf3Q60803 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Traf3Q60803 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Traf3Q60803 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Traf3Q60803 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Traf3Q60803 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Traf3Q60803 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Traf3Q60803 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Traf3Q60803 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Traf3Q60803 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Traf3Q60803 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Traf3Q60803 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Traf3Q60803 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Traf3Q60803 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Traf3Q60803 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Traf3Q60803 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Traf3Q60803 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Traf3Q60803 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Traf3Q60803 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Traf3Q60803 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Traf3Q60803 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Traf3Q60803 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Traf3Q60803 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Traf3Q60803 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Traf3Q60803 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Traf3Q60803 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Traf3Q60803 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Traf3Q60803 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Traf3Q60803 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Traf3Q60803 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Traf3Q60803 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Traf3Q60803 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Traf3Q60803 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Traf3Q60803 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Traf3Q60803 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Traf3Q60803 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Traf3Q60803 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Traf3Q60803 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Traf3Q60803 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Traf3Q60803 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Traf3Q60803 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Traf3Q60803 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Traf3Q60803 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Traf3Q60803 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Traf3Q60803 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Traf3Q60803 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Traf3Q60803 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Traf3Q60803 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Traf3Q60803 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Traf3Q60803 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Traf3Q60803 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Traf3Q60803 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Traf3Q60803 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Traf3Q60803 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Traf3Q60803 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Traf3Q60803 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Traf3Q60803 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Traf3Q60803 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Traf3Q60803 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Traf3Q60803 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Traf3Q60803 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Traf3Q60803 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Traf3Q60803 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Traf3Q60803 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Traf3Q60803 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Traf3Q60803 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Traf3Q60803 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Traf3Q60803 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Traf3Q60803 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Traf3Q60803 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Traf3Q60803 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Traf3Q60803 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Traf3Q60803 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Traf3Q60803 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Traf3Q60803 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Traf3Q60803 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Traf3Q60803 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Traf3Q60803 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Traf3Q60803 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Traf3Q60803 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Traf3Q60803 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Traf3Q60803 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Traf3Q60803 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Traf3Q60803 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Traf3Q60803 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Traf3Q60803 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Traf3Q60803 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Traf3Q60803 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Traf3Q60803 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Traf3Q60803 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Traf3Q60803 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms