Protein–RNA interactions for Protein: Q60662

Akap4, A-kinase anchor protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 849 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Akap4Q60662 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Akap4Q60662 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Akap4Q60662 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Akap4Q60662 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Akap4Q60662 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Akap4Q60662 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Akap4Q60662 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Akap4Q60662 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Akap4Q60662 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Akap4Q60662 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Akap4Q60662 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Akap4Q60662 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Akap4Q60662 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Akap4Q60662 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Akap4Q60662 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Akap4Q60662 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Akap4Q60662 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Akap4Q60662 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Akap4Q60662 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Akap4Q60662 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Akap4Q60662 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Akap4Q60662 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Akap4Q60662 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Akap4Q60662 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Akap4Q60662 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Akap4Q60662 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Akap4Q60662 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Akap4Q60662 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Akap4Q60662 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Akap4Q60662 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Akap4Q60662 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Akap4Q60662 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Akap4Q60662 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Akap4Q60662 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Akap4Q60662 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Akap4Q60662 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Akap4Q60662 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Akap4Q60662 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Akap4Q60662 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Akap4Q60662 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Akap4Q60662 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Akap4Q60662 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Akap4Q60662 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Akap4Q60662 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Akap4Q60662 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Akap4Q60662 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Akap4Q60662 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Akap4Q60662 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Akap4Q60662 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Akap4Q60662 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Akap4Q60662 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Akap4Q60662 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Akap4Q60662 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Akap4Q60662 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Akap4Q60662 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Akap4Q60662 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Akap4Q60662 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Akap4Q60662 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Akap4Q60662 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Akap4Q60662 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Akap4Q60662 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Akap4Q60662 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Akap4Q60662 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Akap4Q60662 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Akap4Q60662 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Akap4Q60662 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Akap4Q60662 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Akap4Q60662 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Akap4Q60662 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Akap4Q60662 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Akap4Q60662 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Akap4Q60662 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Akap4Q60662 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Akap4Q60662 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Akap4Q60662 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Akap4Q60662 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Akap4Q60662 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Akap4Q60662 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Akap4Q60662 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Akap4Q60662 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Akap4Q60662 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Akap4Q60662 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Akap4Q60662 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Akap4Q60662 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Akap4Q60662 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Akap4Q60662 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Akap4Q60662 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Akap4Q60662 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Akap4Q60662 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Akap4Q60662 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Akap4Q60662 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Akap4Q60662 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Akap4Q60662 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Akap4Q60662 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Akap4Q60662 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Akap4Q60662 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Akap4Q60662 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Akap4Q60662 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Akap4Q60662 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Akap4Q60662 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms