Protein–RNA interactions for Protein: Q60636

Prdm1, PR domain zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm1Q60636 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prdm1Q60636 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prdm1Q60636 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prdm1Q60636 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prdm1Q60636 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prdm1Q60636 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Prdm1Q60636 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Prdm1Q60636 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prdm1Q60636 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prdm1Q60636 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prdm1Q60636 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prdm1Q60636 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prdm1Q60636 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prdm1Q60636 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prdm1Q60636 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prdm1Q60636 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prdm1Q60636 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prdm1Q60636 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prdm1Q60636 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prdm1Q60636 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prdm1Q60636 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prdm1Q60636 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prdm1Q60636 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prdm1Q60636 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prdm1Q60636 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prdm1Q60636 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prdm1Q60636 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Prdm1Q60636 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prdm1Q60636 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prdm1Q60636 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prdm1Q60636 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prdm1Q60636 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prdm1Q60636 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prdm1Q60636 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prdm1Q60636 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prdm1Q60636 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prdm1Q60636 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prdm1Q60636 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prdm1Q60636 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prdm1Q60636 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prdm1Q60636 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prdm1Q60636 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prdm1Q60636 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prdm1Q60636 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prdm1Q60636 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prdm1Q60636 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prdm1Q60636 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prdm1Q60636 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prdm1Q60636 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prdm1Q60636 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prdm1Q60636 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prdm1Q60636 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prdm1Q60636 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Prdm1Q60636 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Prdm1Q60636 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prdm1Q60636 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prdm1Q60636 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Prdm1Q60636 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prdm1Q60636 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prdm1Q60636 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prdm1Q60636 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prdm1Q60636 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prdm1Q60636 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prdm1Q60636 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prdm1Q60636 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prdm1Q60636 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prdm1Q60636 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prdm1Q60636 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Prdm1Q60636 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prdm1Q60636 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prdm1Q60636 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prdm1Q60636 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prdm1Q60636 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prdm1Q60636 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prdm1Q60636 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prdm1Q60636 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prdm1Q60636 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prdm1Q60636 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prdm1Q60636 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prdm1Q60636 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prdm1Q60636 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prdm1Q60636 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prdm1Q60636 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prdm1Q60636 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Prdm1Q60636 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Prdm1Q60636 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prdm1Q60636 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prdm1Q60636 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prdm1Q60636 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prdm1Q60636 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prdm1Q60636 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prdm1Q60636 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prdm1Q60636 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Prdm1Q60636 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prdm1Q60636 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prdm1Q60636 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prdm1Q60636 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prdm1Q60636 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prdm1Q60636 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prdm1Q60636 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms