Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CttnQ60598 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CttnQ60598 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CttnQ60598 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CttnQ60598 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CttnQ60598 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CttnQ60598 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CttnQ60598 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CttnQ60598 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CttnQ60598 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CttnQ60598 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CttnQ60598 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CttnQ60598 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CttnQ60598 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CttnQ60598 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CttnQ60598 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CttnQ60598 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CttnQ60598 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CttnQ60598 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CttnQ60598 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CttnQ60598 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CttnQ60598 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CttnQ60598 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CttnQ60598 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CttnQ60598 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CttnQ60598 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CttnQ60598 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CttnQ60598 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CttnQ60598 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CttnQ60598 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CttnQ60598 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CttnQ60598 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CttnQ60598 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CttnQ60598 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CttnQ60598 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CttnQ60598 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CttnQ60598 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CttnQ60598 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CttnQ60598 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CttnQ60598 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CttnQ60598 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CttnQ60598 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CttnQ60598 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CttnQ60598 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CttnQ60598 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CttnQ60598 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CttnQ60598 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CttnQ60598 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CttnQ60598 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CttnQ60598 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CttnQ60598 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CttnQ60598 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CttnQ60598 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CttnQ60598 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CttnQ60598 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CttnQ60598 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CttnQ60598 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CttnQ60598 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CttnQ60598 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CttnQ60598 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CttnQ60598 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CttnQ60598 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CttnQ60598 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CttnQ60598 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CttnQ60598 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CttnQ60598 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CttnQ60598 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CttnQ60598 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CttnQ60598 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CttnQ60598 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CttnQ60598 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CttnQ60598 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CttnQ60598 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CttnQ60598 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CttnQ60598 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CttnQ60598 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CttnQ60598 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CttnQ60598 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CttnQ60598 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CttnQ60598 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CttnQ60598 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CttnQ60598 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CttnQ60598 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CttnQ60598 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CttnQ60598 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CttnQ60598 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CttnQ60598 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CttnQ60598 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CttnQ60598 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CttnQ60598 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CttnQ60598 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CttnQ60598 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CttnQ60598 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CttnQ60598 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CttnQ60598 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CttnQ60598 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CttnQ60598 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CttnQ60598 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CttnQ60598 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CttnQ60598 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms