Protein–RNA interactions for Protein: Q5RKV8

Pfpl, Pfpl protein, mousemouse

Predictions only

Length 702 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PfplQ5RKV8 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PfplQ5RKV8 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PfplQ5RKV8 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PfplQ5RKV8 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PfplQ5RKV8 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PfplQ5RKV8 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PfplQ5RKV8 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PfplQ5RKV8 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PfplQ5RKV8 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PfplQ5RKV8 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PfplQ5RKV8 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PfplQ5RKV8 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PfplQ5RKV8 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PfplQ5RKV8 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PfplQ5RKV8 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PfplQ5RKV8 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PfplQ5RKV8 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PfplQ5RKV8 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PfplQ5RKV8 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PfplQ5RKV8 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PfplQ5RKV8 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PfplQ5RKV8 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PfplQ5RKV8 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PfplQ5RKV8 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PfplQ5RKV8 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PfplQ5RKV8 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PfplQ5RKV8 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PfplQ5RKV8 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PfplQ5RKV8 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PfplQ5RKV8 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PfplQ5RKV8 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PfplQ5RKV8 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PfplQ5RKV8 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PfplQ5RKV8 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PfplQ5RKV8 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PfplQ5RKV8 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.06
PfplQ5RKV8 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PfplQ5RKV8 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PfplQ5RKV8 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PfplQ5RKV8 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PfplQ5RKV8 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PfplQ5RKV8 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PfplQ5RKV8 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PfplQ5RKV8 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PfplQ5RKV8 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PfplQ5RKV8 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PfplQ5RKV8 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PfplQ5RKV8 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PfplQ5RKV8 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PfplQ5RKV8 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PfplQ5RKV8 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PfplQ5RKV8 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PfplQ5RKV8 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PfplQ5RKV8 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PfplQ5RKV8 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PfplQ5RKV8 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PfplQ5RKV8 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PfplQ5RKV8 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PfplQ5RKV8 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PfplQ5RKV8 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PfplQ5RKV8 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PfplQ5RKV8 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PfplQ5RKV8 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PfplQ5RKV8 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PfplQ5RKV8 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PfplQ5RKV8 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PfplQ5RKV8 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PfplQ5RKV8 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PfplQ5RKV8 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PfplQ5RKV8 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PfplQ5RKV8 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PfplQ5RKV8 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PfplQ5RKV8 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PfplQ5RKV8 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PfplQ5RKV8 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PfplQ5RKV8 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PfplQ5RKV8 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PfplQ5RKV8 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PfplQ5RKV8 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PfplQ5RKV8 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PfplQ5RKV8 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PfplQ5RKV8 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PfplQ5RKV8 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PfplQ5RKV8 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PfplQ5RKV8 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PfplQ5RKV8 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PfplQ5RKV8 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PfplQ5RKV8 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PfplQ5RKV8 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PfplQ5RKV8 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PfplQ5RKV8 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PfplQ5RKV8 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PfplQ5RKV8 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PfplQ5RKV8 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PfplQ5RKV8 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PfplQ5RKV8 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PfplQ5RKV8 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PfplQ5RKV8 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PfplQ5RKV8 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PfplQ5RKV8 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms