Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1A4

Trdv2-2, T cell receptor delta variable 2-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv2-2Q5R1A4 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms