Protein–RNA interactions for Protein: Q5QGU6

Rtp3, Receptor-transporting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtp3Q5QGU6 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rtp3Q5QGU6 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rtp3Q5QGU6 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rtp3Q5QGU6 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rtp3Q5QGU6 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Rtp3Q5QGU6 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Rtp3Q5QGU6 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rtp3Q5QGU6 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rtp3Q5QGU6 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rtp3Q5QGU6 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rtp3Q5QGU6 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rtp3Q5QGU6 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rtp3Q5QGU6 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rtp3Q5QGU6 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rtp3Q5QGU6 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rtp3Q5QGU6 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rtp3Q5QGU6 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rtp3Q5QGU6 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Rtp3Q5QGU6 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Rtp3Q5QGU6 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rtp3Q5QGU6 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rtp3Q5QGU6 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rtp3Q5QGU6 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rtp3Q5QGU6 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rtp3Q5QGU6 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rtp3Q5QGU6 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rtp3Q5QGU6 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rtp3Q5QGU6 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rtp3Q5QGU6 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rtp3Q5QGU6 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rtp3Q5QGU6 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rtp3Q5QGU6 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rtp3Q5QGU6 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms