Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC05

Ttf2, Transcription termination factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf2Q5NC05 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttf2Q5NC05 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttf2Q5NC05 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttf2Q5NC05 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttf2Q5NC05 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttf2Q5NC05 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttf2Q5NC05 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttf2Q5NC05 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttf2Q5NC05 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttf2Q5NC05 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttf2Q5NC05 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttf2Q5NC05 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttf2Q5NC05 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttf2Q5NC05 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttf2Q5NC05 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttf2Q5NC05 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttf2Q5NC05 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttf2Q5NC05 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttf2Q5NC05 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttf2Q5NC05 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttf2Q5NC05 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttf2Q5NC05 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttf2Q5NC05 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttf2Q5NC05 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttf2Q5NC05 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttf2Q5NC05 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttf2Q5NC05 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttf2Q5NC05 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttf2Q5NC05 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttf2Q5NC05 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttf2Q5NC05 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttf2Q5NC05 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttf2Q5NC05 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttf2Q5NC05 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttf2Q5NC05 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttf2Q5NC05 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttf2Q5NC05 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttf2Q5NC05 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttf2Q5NC05 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttf2Q5NC05 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttf2Q5NC05 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttf2Q5NC05 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttf2Q5NC05 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttf2Q5NC05 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttf2Q5NC05 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttf2Q5NC05 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttf2Q5NC05 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttf2Q5NC05 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttf2Q5NC05 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttf2Q5NC05 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttf2Q5NC05 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttf2Q5NC05 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttf2Q5NC05 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttf2Q5NC05 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttf2Q5NC05 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttf2Q5NC05 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttf2Q5NC05 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttf2Q5NC05 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttf2Q5NC05 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttf2Q5NC05 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttf2Q5NC05 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttf2Q5NC05 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttf2Q5NC05 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttf2Q5NC05 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttf2Q5NC05 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttf2Q5NC05 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttf2Q5NC05 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttf2Q5NC05 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttf2Q5NC05 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttf2Q5NC05 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttf2Q5NC05 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttf2Q5NC05 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttf2Q5NC05 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttf2Q5NC05 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttf2Q5NC05 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttf2Q5NC05 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttf2Q5NC05 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttf2Q5NC05 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttf2Q5NC05 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttf2Q5NC05 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttf2Q5NC05 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttf2Q5NC05 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttf2Q5NC05 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttf2Q5NC05 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttf2Q5NC05 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttf2Q5NC05 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttf2Q5NC05 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttf2Q5NC05 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttf2Q5NC05 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttf2Q5NC05 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttf2Q5NC05 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttf2Q5NC05 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttf2Q5NC05 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttf2Q5NC05 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttf2Q5NC05 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttf2Q5NC05 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttf2Q5NC05 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttf2Q5NC05 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttf2Q5NC05 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttf2Q5NC05 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms