Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

Predictions only

Length 2,382 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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