Protein–RNA interactions for Protein: Q58A65

Spag9, C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,321 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spag9Q58A65 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Spag9Q58A65 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Spag9Q58A65 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Spag9Q58A65 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Spag9Q58A65 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Spag9Q58A65 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Spag9Q58A65 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Spag9Q58A65 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Spag9Q58A65 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Spag9Q58A65 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Spag9Q58A65 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Spag9Q58A65 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Spag9Q58A65 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Spag9Q58A65 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Spag9Q58A65 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Spag9Q58A65 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Spag9Q58A65 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Spag9Q58A65 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Spag9Q58A65 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Spag9Q58A65 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Spag9Q58A65 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Spag9Q58A65 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Spag9Q58A65 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Spag9Q58A65 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Spag9Q58A65 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Spag9Q58A65 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Spag9Q58A65 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Spag9Q58A65 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Spag9Q58A65 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Spag9Q58A65 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Spag9Q58A65 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Spag9Q58A65 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Spag9Q58A65 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Spag9Q58A65 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Spag9Q58A65 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Spag9Q58A65 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Spag9Q58A65 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Spag9Q58A65 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Spag9Q58A65 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Spag9Q58A65 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Spag9Q58A65 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Spag9Q58A65 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Spag9Q58A65 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Spag9Q58A65 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Spag9Q58A65 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Spag9Q58A65 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Spag9Q58A65 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Spag9Q58A65 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Spag9Q58A65 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Spag9Q58A65 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Spag9Q58A65 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Spag9Q58A65 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Spag9Q58A65 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Spag9Q58A65 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Spag9Q58A65 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Spag9Q58A65 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Spag9Q58A65 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Spag9Q58A65 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Spag9Q58A65 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Spag9Q58A65 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Spag9Q58A65 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Spag9Q58A65 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Spag9Q58A65 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Spag9Q58A65 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Spag9Q58A65 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Spag9Q58A65 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Spag9Q58A65 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Spag9Q58A65 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Spag9Q58A65 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Spag9Q58A65 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Spag9Q58A65 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Spag9Q58A65 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Spag9Q58A65 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Spag9Q58A65 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Spag9Q58A65 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Spag9Q58A65 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Spag9Q58A65 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Spag9Q58A65 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Spag9Q58A65 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Spag9Q58A65 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Spag9Q58A65 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Spag9Q58A65 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Spag9Q58A65 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Spag9Q58A65 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Spag9Q58A65 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Spag9Q58A65 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Spag9Q58A65 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Spag9Q58A65 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Spag9Q58A65 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Spag9Q58A65 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Spag9Q58A65 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Spag9Q58A65 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Spag9Q58A65 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Spag9Q58A65 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Spag9Q58A65 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Spag9Q58A65 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Spag9Q58A65 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Spag9Q58A65 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Spag9Q58A65 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Spag9Q58A65 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms