Protein–RNA interactions for Protein: Q52KR2

Lrig2, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig2Q52KR2 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrig2Q52KR2 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrig2Q52KR2 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrig2Q52KR2 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrig2Q52KR2 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrig2Q52KR2 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrig2Q52KR2 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrig2Q52KR2 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrig2Q52KR2 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrig2Q52KR2 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrig2Q52KR2 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrig2Q52KR2 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrig2Q52KR2 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrig2Q52KR2 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrig2Q52KR2 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrig2Q52KR2 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrig2Q52KR2 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrig2Q52KR2 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrig2Q52KR2 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrig2Q52KR2 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrig2Q52KR2 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrig2Q52KR2 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrig2Q52KR2 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrig2Q52KR2 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrig2Q52KR2 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrig2Q52KR2 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrig2Q52KR2 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrig2Q52KR2 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrig2Q52KR2 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrig2Q52KR2 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrig2Q52KR2 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrig2Q52KR2 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrig2Q52KR2 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrig2Q52KR2 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrig2Q52KR2 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrig2Q52KR2 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrig2Q52KR2 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrig2Q52KR2 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrig2Q52KR2 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrig2Q52KR2 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrig2Q52KR2 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrig2Q52KR2 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrig2Q52KR2 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrig2Q52KR2 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrig2Q52KR2 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrig2Q52KR2 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrig2Q52KR2 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrig2Q52KR2 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrig2Q52KR2 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrig2Q52KR2 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrig2Q52KR2 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrig2Q52KR2 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrig2Q52KR2 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrig2Q52KR2 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrig2Q52KR2 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrig2Q52KR2 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrig2Q52KR2 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrig2Q52KR2 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrig2Q52KR2 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrig2Q52KR2 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrig2Q52KR2 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrig2Q52KR2 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrig2Q52KR2 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrig2Q52KR2 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrig2Q52KR2 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrig2Q52KR2 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrig2Q52KR2 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrig2Q52KR2 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrig2Q52KR2 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lrig2Q52KR2 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lrig2Q52KR2 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lrig2Q52KR2 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lrig2Q52KR2 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lrig2Q52KR2 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrig2Q52KR2 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrig2Q52KR2 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrig2Q52KR2 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrig2Q52KR2 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrig2Q52KR2 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrig2Q52KR2 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrig2Q52KR2 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrig2Q52KR2 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrig2Q52KR2 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrig2Q52KR2 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrig2Q52KR2 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrig2Q52KR2 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrig2Q52KR2 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrig2Q52KR2 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrig2Q52KR2 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrig2Q52KR2 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrig2Q52KR2 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrig2Q52KR2 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrig2Q52KR2 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrig2Q52KR2 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrig2Q52KR2 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrig2Q52KR2 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrig2Q52KR2 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrig2Q52KR2 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrig2Q52KR2 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrig2Q52KR2 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms