Protein–RNA interactions for Protein: Q4TU90

Rhox3a, Reproductive homeobox 3A, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox3aQ4TU90 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhox3aQ4TU90 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhox3aQ4TU90 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhox3aQ4TU90 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhox3aQ4TU90 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhox3aQ4TU90 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhox3aQ4TU90 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhox3aQ4TU90 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhox3aQ4TU90 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhox3aQ4TU90 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhox3aQ4TU90 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhox3aQ4TU90 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhox3aQ4TU90 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhox3aQ4TU90 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhox3aQ4TU90 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhox3aQ4TU90 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhox3aQ4TU90 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhox3aQ4TU90 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhox3aQ4TU90 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhox3aQ4TU90 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhox3aQ4TU90 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhox3aQ4TU90 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhox3aQ4TU90 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhox3aQ4TU90 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhox3aQ4TU90 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhox3aQ4TU90 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhox3aQ4TU90 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhox3aQ4TU90 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhox3aQ4TU90 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhox3aQ4TU90 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhox3aQ4TU90 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhox3aQ4TU90 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhox3aQ4TU90 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhox3aQ4TU90 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhox3aQ4TU90 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhox3aQ4TU90 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhox3aQ4TU90 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhox3aQ4TU90 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhox3aQ4TU90 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhox3aQ4TU90 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhox3aQ4TU90 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhox3aQ4TU90 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhox3aQ4TU90 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhox3aQ4TU90 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhox3aQ4TU90 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhox3aQ4TU90 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhox3aQ4TU90 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhox3aQ4TU90 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhox3aQ4TU90 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhox3aQ4TU90 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhox3aQ4TU90 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhox3aQ4TU90 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhox3aQ4TU90 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhox3aQ4TU90 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhox3aQ4TU90 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhox3aQ4TU90 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhox3aQ4TU90 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhox3aQ4TU90 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhox3aQ4TU90 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhox3aQ4TU90 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhox3aQ4TU90 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhox3aQ4TU90 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhox3aQ4TU90 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhox3aQ4TU90 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhox3aQ4TU90 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhox3aQ4TU90 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhox3aQ4TU90 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhox3aQ4TU90 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhox3aQ4TU90 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhox3aQ4TU90 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhox3aQ4TU90 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhox3aQ4TU90 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhox3aQ4TU90 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhox3aQ4TU90 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhox3aQ4TU90 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhox3aQ4TU90 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhox3aQ4TU90 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhox3aQ4TU90 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhox3aQ4TU90 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhox3aQ4TU90 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhox3aQ4TU90 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhox3aQ4TU90 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhox3aQ4TU90 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhox3aQ4TU90 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhox3aQ4TU90 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhox3aQ4TU90 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhox3aQ4TU90 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rhox3aQ4TU90 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rhox3aQ4TU90 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rhox3aQ4TU90 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rhox3aQ4TU90 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rhox3aQ4TU90 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rhox3aQ4TU90 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rhox3aQ4TU90 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rhox3aQ4TU90 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rhox3aQ4TU90 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rhox3aQ4TU90 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rhox3aQ4TU90 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rhox3aQ4TU90 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rhox3aQ4TU90 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74 ms