Protein–RNA interactions for Protein: Q4FZC9

Syne3, Nesprin-3, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne3Q4FZC9 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syne3Q4FZC9 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syne3Q4FZC9 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syne3Q4FZC9 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syne3Q4FZC9 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Syne3Q4FZC9 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Syne3Q4FZC9 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syne3Q4FZC9 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syne3Q4FZC9 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syne3Q4FZC9 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syne3Q4FZC9 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syne3Q4FZC9 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syne3Q4FZC9 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syne3Q4FZC9 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syne3Q4FZC9 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syne3Q4FZC9 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syne3Q4FZC9 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syne3Q4FZC9 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Syne3Q4FZC9 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syne3Q4FZC9 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syne3Q4FZC9 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Syne3Q4FZC9 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syne3Q4FZC9 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syne3Q4FZC9 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syne3Q4FZC9 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syne3Q4FZC9 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syne3Q4FZC9 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syne3Q4FZC9 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syne3Q4FZC9 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syne3Q4FZC9 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syne3Q4FZC9 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syne3Q4FZC9 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syne3Q4FZC9 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syne3Q4FZC9 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syne3Q4FZC9 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syne3Q4FZC9 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syne3Q4FZC9 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syne3Q4FZC9 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syne3Q4FZC9 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syne3Q4FZC9 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syne3Q4FZC9 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syne3Q4FZC9 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syne3Q4FZC9 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syne3Q4FZC9 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syne3Q4FZC9 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syne3Q4FZC9 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syne3Q4FZC9 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syne3Q4FZC9 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Syne3Q4FZC9 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syne3Q4FZC9 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syne3Q4FZC9 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syne3Q4FZC9 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syne3Q4FZC9 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syne3Q4FZC9 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syne3Q4FZC9 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syne3Q4FZC9 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syne3Q4FZC9 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syne3Q4FZC9 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syne3Q4FZC9 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syne3Q4FZC9 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syne3Q4FZC9 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syne3Q4FZC9 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syne3Q4FZC9 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syne3Q4FZC9 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syne3Q4FZC9 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Syne3Q4FZC9 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Syne3Q4FZC9 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syne3Q4FZC9 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syne3Q4FZC9 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syne3Q4FZC9 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syne3Q4FZC9 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syne3Q4FZC9 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syne3Q4FZC9 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syne3Q4FZC9 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syne3Q4FZC9 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syne3Q4FZC9 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syne3Q4FZC9 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syne3Q4FZC9 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syne3Q4FZC9 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syne3Q4FZC9 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syne3Q4FZC9 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syne3Q4FZC9 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syne3Q4FZC9 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Syne3Q4FZC9 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syne3Q4FZC9 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syne3Q4FZC9 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syne3Q4FZC9 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syne3Q4FZC9 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syne3Q4FZC9 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syne3Q4FZC9 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syne3Q4FZC9 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syne3Q4FZC9 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syne3Q4FZC9 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syne3Q4FZC9 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syne3Q4FZC9 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syne3Q4FZC9 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syne3Q4FZC9 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Syne3Q4FZC9 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Syne3Q4FZC9 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Syne3Q4FZC9 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms