Protein–RNA interactions for Protein: Q4FK66

Prpf38a, Pre-mRNA-splicing factor 38A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf38aQ4FK66 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prpf38aQ4FK66 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prpf38aQ4FK66 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Prpf38aQ4FK66 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prpf38aQ4FK66 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prpf38aQ4FK66 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prpf38aQ4FK66 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prpf38aQ4FK66 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prpf38aQ4FK66 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prpf38aQ4FK66 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prpf38aQ4FK66 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prpf38aQ4FK66 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prpf38aQ4FK66 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prpf38aQ4FK66 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prpf38aQ4FK66 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prpf38aQ4FK66 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prpf38aQ4FK66 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Prpf38aQ4FK66 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prpf38aQ4FK66 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prpf38aQ4FK66 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prpf38aQ4FK66 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prpf38aQ4FK66 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prpf38aQ4FK66 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prpf38aQ4FK66 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prpf38aQ4FK66 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Prpf38aQ4FK66 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Prpf38aQ4FK66 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prpf38aQ4FK66 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prpf38aQ4FK66 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prpf38aQ4FK66 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prpf38aQ4FK66 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prpf38aQ4FK66 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prpf38aQ4FK66 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prpf38aQ4FK66 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prpf38aQ4FK66 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prpf38aQ4FK66 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prpf38aQ4FK66 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Prpf38aQ4FK66 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prpf38aQ4FK66 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prpf38aQ4FK66 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prpf38aQ4FK66 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prpf38aQ4FK66 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prpf38aQ4FK66 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prpf38aQ4FK66 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prpf38aQ4FK66 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prpf38aQ4FK66 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prpf38aQ4FK66 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prpf38aQ4FK66 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prpf38aQ4FK66 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prpf38aQ4FK66 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prpf38aQ4FK66 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Prpf38aQ4FK66 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prpf38aQ4FK66 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prpf38aQ4FK66 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prpf38aQ4FK66 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prpf38aQ4FK66 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prpf38aQ4FK66 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prpf38aQ4FK66 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prpf38aQ4FK66 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Prpf38aQ4FK66 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prpf38aQ4FK66 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prpf38aQ4FK66 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prpf38aQ4FK66 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prpf38aQ4FK66 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prpf38aQ4FK66 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prpf38aQ4FK66 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prpf38aQ4FK66 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prpf38aQ4FK66 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prpf38aQ4FK66 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prpf38aQ4FK66 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prpf38aQ4FK66 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prpf38aQ4FK66 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prpf38aQ4FK66 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Prpf38aQ4FK66 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prpf38aQ4FK66 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prpf38aQ4FK66 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prpf38aQ4FK66 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prpf38aQ4FK66 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Prpf38aQ4FK66 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Prpf38aQ4FK66 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Prpf38aQ4FK66 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Prpf38aQ4FK66 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prpf38aQ4FK66 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prpf38aQ4FK66 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prpf38aQ4FK66 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prpf38aQ4FK66 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prpf38aQ4FK66 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prpf38aQ4FK66 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Prpf38aQ4FK66 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prpf38aQ4FK66 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prpf38aQ4FK66 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prpf38aQ4FK66 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prpf38aQ4FK66 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prpf38aQ4FK66 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prpf38aQ4FK66 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prpf38aQ4FK66 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prpf38aQ4FK66 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prpf38aQ4FK66 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prpf38aQ4FK66 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prpf38aQ4FK66 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms