Protein–RNA interactions for Protein: Q499D5

Zfp235, Zinc finger protein 235, mousemouse

Predictions only

Length 702 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp235Q499D5 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Zfp235Q499D5 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Zfp235Q499D5 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Zfp235Q499D5 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Zfp235Q499D5 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Zfp235Q499D5 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Zfp235Q499D5 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Zfp235Q499D5 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Zfp235Q499D5 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zfp235Q499D5 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Zfp235Q499D5 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zfp235Q499D5 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zfp235Q499D5 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zfp235Q499D5 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Zfp235Q499D5 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zfp235Q499D5 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Zfp235Q499D5 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Zfp235Q499D5 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zfp235Q499D5 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zfp235Q499D5 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zfp235Q499D5 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Zfp235Q499D5 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zfp235Q499D5 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Zfp235Q499D5 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Zfp235Q499D5 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Zfp235Q499D5 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zfp235Q499D5 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zfp235Q499D5 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zfp235Q499D5 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zfp235Q499D5 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zfp235Q499D5 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zfp235Q499D5 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zfp235Q499D5 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zfp235Q499D5 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zfp235Q499D5 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zfp235Q499D5 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Zfp235Q499D5 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Zfp235Q499D5 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Zfp235Q499D5 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Zfp235Q499D5 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Zfp235Q499D5 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Zfp235Q499D5 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Zfp235Q499D5 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Zfp235Q499D5 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Zfp235Q499D5 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Zfp235Q499D5 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Zfp235Q499D5 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Zfp235Q499D5 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Zfp235Q499D5 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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