Protein–RNA interactions for Protein: Q45KJ6

Lin28b, Protein lin-28 homolog B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin28bQ45KJ6 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lin28bQ45KJ6 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lin28bQ45KJ6 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Lin28bQ45KJ6 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lin28bQ45KJ6 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lin28bQ45KJ6 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lin28bQ45KJ6 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lin28bQ45KJ6 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lin28bQ45KJ6 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lin28bQ45KJ6 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lin28bQ45KJ6 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lin28bQ45KJ6 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Lin28bQ45KJ6 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lin28bQ45KJ6 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lin28bQ45KJ6 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lin28bQ45KJ6 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lin28bQ45KJ6 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lin28bQ45KJ6 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lin28bQ45KJ6 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lin28bQ45KJ6 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lin28bQ45KJ6 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lin28bQ45KJ6 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lin28bQ45KJ6 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lin28bQ45KJ6 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lin28bQ45KJ6 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Lin28bQ45KJ6 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Lin28bQ45KJ6 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lin28bQ45KJ6 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lin28bQ45KJ6 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lin28bQ45KJ6 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lin28bQ45KJ6 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lin28bQ45KJ6 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lin28bQ45KJ6 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lin28bQ45KJ6 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lin28bQ45KJ6 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lin28bQ45KJ6 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lin28bQ45KJ6 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lin28bQ45KJ6 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lin28bQ45KJ6 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Lin28bQ45KJ6 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Lin28bQ45KJ6 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Lin28bQ45KJ6 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Lin28bQ45KJ6 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lin28bQ45KJ6 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lin28bQ45KJ6 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lin28bQ45KJ6 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lin28bQ45KJ6 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lin28bQ45KJ6 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lin28bQ45KJ6 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lin28bQ45KJ6 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lin28bQ45KJ6 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lin28bQ45KJ6 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lin28bQ45KJ6 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lin28bQ45KJ6 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lin28bQ45KJ6 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lin28bQ45KJ6 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lin28bQ45KJ6 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lin28bQ45KJ6 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lin28bQ45KJ6 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lin28bQ45KJ6 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lin28bQ45KJ6 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lin28bQ45KJ6 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lin28bQ45KJ6 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lin28bQ45KJ6 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Lin28bQ45KJ6 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lin28bQ45KJ6 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lin28bQ45KJ6 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lin28bQ45KJ6 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lin28bQ45KJ6 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lin28bQ45KJ6 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lin28bQ45KJ6 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Lin28bQ45KJ6 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Lin28bQ45KJ6 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Lin28bQ45KJ6 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Lin28bQ45KJ6 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Lin28bQ45KJ6 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lin28bQ45KJ6 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lin28bQ45KJ6 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lin28bQ45KJ6 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lin28bQ45KJ6 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lin28bQ45KJ6 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lin28bQ45KJ6 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lin28bQ45KJ6 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lin28bQ45KJ6 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lin28bQ45KJ6 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lin28bQ45KJ6 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lin28bQ45KJ6 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lin28bQ45KJ6 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lin28bQ45KJ6 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lin28bQ45KJ6 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lin28bQ45KJ6 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Lin28bQ45KJ6 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lin28bQ45KJ6 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lin28bQ45KJ6 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Lin28bQ45KJ6 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lin28bQ45KJ6 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lin28bQ45KJ6 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lin28bQ45KJ6 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lin28bQ45KJ6 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lin28bQ45KJ6 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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