Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZT31

Snx25, Sorting nexin-25, mousemouse

Predictions only

Length 840 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx25Q3ZT31 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx25Q3ZT31 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx25Q3ZT31 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx25Q3ZT31 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx25Q3ZT31 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx25Q3ZT31 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx25Q3ZT31 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx25Q3ZT31 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Snx25Q3ZT31 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx25Q3ZT31 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx25Q3ZT31 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Snx25Q3ZT31 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Snx25Q3ZT31 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx25Q3ZT31 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx25Q3ZT31 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Snx25Q3ZT31 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Snx25Q3ZT31 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx25Q3ZT31 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Snx25Q3ZT31 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx25Q3ZT31 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Snx25Q3ZT31 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Snx25Q3ZT31 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Snx25Q3ZT31 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snx25Q3ZT31 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snx25Q3ZT31 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Snx25Q3ZT31 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Snx25Q3ZT31 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Snx25Q3ZT31 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Snx25Q3ZT31 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Snx25Q3ZT31 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx25Q3ZT31 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx25Q3ZT31 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Snx25Q3ZT31 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx25Q3ZT31 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx25Q3ZT31 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx25Q3ZT31 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx25Q3ZT31 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx25Q3ZT31 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx25Q3ZT31 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx25Q3ZT31 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms