Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3Q4

Pydc3, Pyrin domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pydc3Q3V3Q4 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms