Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0I2

Prr7, Proline-rich protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr7Q3V0I2 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prr7Q3V0I2 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prr7Q3V0I2 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Prr7Q3V0I2 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Prr7Q3V0I2 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prr7Q3V0I2 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prr7Q3V0I2 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prr7Q3V0I2 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prr7Q3V0I2 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prr7Q3V0I2 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prr7Q3V0I2 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prr7Q3V0I2 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prr7Q3V0I2 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prr7Q3V0I2 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prr7Q3V0I2 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prr7Q3V0I2 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prr7Q3V0I2 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prr7Q3V0I2 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prr7Q3V0I2 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prr7Q3V0I2 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prr7Q3V0I2 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prr7Q3V0I2 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prr7Q3V0I2 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prr7Q3V0I2 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prr7Q3V0I2 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prr7Q3V0I2 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prr7Q3V0I2 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prr7Q3V0I2 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prr7Q3V0I2 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prr7Q3V0I2 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prr7Q3V0I2 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Prr7Q3V0I2 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prr7Q3V0I2 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prr7Q3V0I2 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prr7Q3V0I2 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prr7Q3V0I2 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prr7Q3V0I2 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prr7Q3V0I2 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Prr7Q3V0I2 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prr7Q3V0I2 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prr7Q3V0I2 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prr7Q3V0I2 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prr7Q3V0I2 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prr7Q3V0I2 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prr7Q3V0I2 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prr7Q3V0I2 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prr7Q3V0I2 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prr7Q3V0I2 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prr7Q3V0I2 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prr7Q3V0I2 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prr7Q3V0I2 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prr7Q3V0I2 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prr7Q3V0I2 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prr7Q3V0I2 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prr7Q3V0I2 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prr7Q3V0I2 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prr7Q3V0I2 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prr7Q3V0I2 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prr7Q3V0I2 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prr7Q3V0I2 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prr7Q3V0I2 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prr7Q3V0I2 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prr7Q3V0I2 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Prr7Q3V0I2 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prr7Q3V0I2 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Prr7Q3V0I2 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prr7Q3V0I2 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prr7Q3V0I2 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prr7Q3V0I2 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prr7Q3V0I2 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prr7Q3V0I2 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prr7Q3V0I2 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prr7Q3V0I2 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prr7Q3V0I2 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prr7Q3V0I2 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prr7Q3V0I2 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prr7Q3V0I2 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prr7Q3V0I2 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prr7Q3V0I2 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prr7Q3V0I2 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prr7Q3V0I2 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prr7Q3V0I2 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prr7Q3V0I2 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prr7Q3V0I2 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prr7Q3V0I2 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prr7Q3V0I2 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prr7Q3V0I2 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prr7Q3V0I2 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Prr7Q3V0I2 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prr7Q3V0I2 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prr7Q3V0I2 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prr7Q3V0I2 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prr7Q3V0I2 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prr7Q3V0I2 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prr7Q3V0I2 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prr7Q3V0I2 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prr7Q3V0I2 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prr7Q3V0I2 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prr7Q3V0I2 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prr7Q3V0I2 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms