Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZD5

Prdm6, Putative histone-lysine N-methyltransferase PRDM6, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm6Q3UZD5 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Prdm6Q3UZD5 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prdm6Q3UZD5 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Prdm6Q3UZD5 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Prdm6Q3UZD5 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prdm6Q3UZD5 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prdm6Q3UZD5 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prdm6Q3UZD5 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prdm6Q3UZD5 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Prdm6Q3UZD5 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Prdm6Q3UZD5 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Prdm6Q3UZD5 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Prdm6Q3UZD5 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Prdm6Q3UZD5 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Prdm6Q3UZD5 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Prdm6Q3UZD5 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Prdm6Q3UZD5 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Prdm6Q3UZD5 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Prdm6Q3UZD5 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Prdm6Q3UZD5 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Prdm6Q3UZD5 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Prdm6Q3UZD5 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Prdm6Q3UZD5 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Prdm6Q3UZD5 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Prdm6Q3UZD5 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Prdm6Q3UZD5 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Prdm6Q3UZD5 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Prdm6Q3UZD5 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Prdm6Q3UZD5 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Prdm6Q3UZD5 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Prdm6Q3UZD5 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Prdm6Q3UZD5 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Prdm6Q3UZD5 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Prdm6Q3UZD5 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Prdm6Q3UZD5 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Prdm6Q3UZD5 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prdm6Q3UZD5 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prdm6Q3UZD5 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prdm6Q3UZD5 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prdm6Q3UZD5 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prdm6Q3UZD5 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prdm6Q3UZD5 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prdm6Q3UZD5 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prdm6Q3UZD5 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prdm6Q3UZD5 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prdm6Q3UZD5 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prdm6Q3UZD5 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prdm6Q3UZD5 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prdm6Q3UZD5 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prdm6Q3UZD5 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prdm6Q3UZD5 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prdm6Q3UZD5 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prdm6Q3UZD5 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prdm6Q3UZD5 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Prdm6Q3UZD5 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Prdm6Q3UZD5 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prdm6Q3UZD5 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Prdm6Q3UZD5 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Prdm6Q3UZD5 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prdm6Q3UZD5 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prdm6Q3UZD5 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prdm6Q3UZD5 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prdm6Q3UZD5 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prdm6Q3UZD5 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prdm6Q3UZD5 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Prdm6Q3UZD5 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prdm6Q3UZD5 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prdm6Q3UZD5 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prdm6Q3UZD5 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prdm6Q3UZD5 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prdm6Q3UZD5 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prdm6Q3UZD5 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prdm6Q3UZD5 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prdm6Q3UZD5 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prdm6Q3UZD5 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prdm6Q3UZD5 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prdm6Q3UZD5 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prdm6Q3UZD5 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prdm6Q3UZD5 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prdm6Q3UZD5 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prdm6Q3UZD5 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prdm6Q3UZD5 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Prdm6Q3UZD5 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prdm6Q3UZD5 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prdm6Q3UZD5 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prdm6Q3UZD5 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prdm6Q3UZD5 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prdm6Q3UZD5 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Prdm6Q3UZD5 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Prdm6Q3UZD5 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Prdm6Q3UZD5 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prdm6Q3UZD5 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prdm6Q3UZD5 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Prdm6Q3UZD5 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prdm6Q3UZD5 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prdm6Q3UZD5 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prdm6Q3UZD5 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prdm6Q3UZD5 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Prdm6Q3UZD5 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prdm6Q3UZD5 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms