Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYG1

Ccdc160, Coiled-coil domain-containing protein 160, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc160Q3UYG1 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc160Q3UYG1 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc160Q3UYG1 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc160Q3UYG1 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc160Q3UYG1 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc160Q3UYG1 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc160Q3UYG1 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc160Q3UYG1 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc160Q3UYG1 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc160Q3UYG1 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc160Q3UYG1 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc160Q3UYG1 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc160Q3UYG1 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc160Q3UYG1 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc160Q3UYG1 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc160Q3UYG1 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc160Q3UYG1 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc160Q3UYG1 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc160Q3UYG1 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc160Q3UYG1 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc160Q3UYG1 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc160Q3UYG1 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc160Q3UYG1 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc160Q3UYG1 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc160Q3UYG1 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc160Q3UYG1 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc160Q3UYG1 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc160Q3UYG1 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc160Q3UYG1 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc160Q3UYG1 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc160Q3UYG1 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc160Q3UYG1 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc160Q3UYG1 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc160Q3UYG1 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc160Q3UYG1 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc160Q3UYG1 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc160Q3UYG1 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc160Q3UYG1 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc160Q3UYG1 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc160Q3UYG1 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc160Q3UYG1 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc160Q3UYG1 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc160Q3UYG1 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc160Q3UYG1 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc160Q3UYG1 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc160Q3UYG1 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc160Q3UYG1 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc160Q3UYG1 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc160Q3UYG1 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc160Q3UYG1 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc160Q3UYG1 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc160Q3UYG1 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc160Q3UYG1 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc160Q3UYG1 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc160Q3UYG1 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc160Q3UYG1 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc160Q3UYG1 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc160Q3UYG1 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc160Q3UYG1 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc160Q3UYG1 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc160Q3UYG1 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc160Q3UYG1 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc160Q3UYG1 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc160Q3UYG1 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc160Q3UYG1 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc160Q3UYG1 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc160Q3UYG1 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc160Q3UYG1 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc160Q3UYG1 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc160Q3UYG1 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc160Q3UYG1 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc160Q3UYG1 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc160Q3UYG1 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc160Q3UYG1 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc160Q3UYG1 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc160Q3UYG1 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc160Q3UYG1 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc160Q3UYG1 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc160Q3UYG1 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc160Q3UYG1 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc160Q3UYG1 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc160Q3UYG1 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc160Q3UYG1 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc160Q3UYG1 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc160Q3UYG1 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc160Q3UYG1 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc160Q3UYG1 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc160Q3UYG1 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc160Q3UYG1 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc160Q3UYG1 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc160Q3UYG1 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc160Q3UYG1 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc160Q3UYG1 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc160Q3UYG1 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc160Q3UYG1 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc160Q3UYG1 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc160Q3UYG1 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc160Q3UYG1 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc160Q3UYG1 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc160Q3UYG1 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms