Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW68

Capn13, Calpain-13, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn13Q3UW68 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms