Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW13

D130052B06Rik, RIKEN cDNA D130052B06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D130052B06RikQ3UW13 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
D130052B06RikQ3UW13 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
D130052B06RikQ3UW13 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
D130052B06RikQ3UW13 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
D130052B06RikQ3UW13 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
D130052B06RikQ3UW13 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
D130052B06RikQ3UW13 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
D130052B06RikQ3UW13 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
D130052B06RikQ3UW13 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
D130052B06RikQ3UW13 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
D130052B06RikQ3UW13 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
D130052B06RikQ3UW13 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
D130052B06RikQ3UW13 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
D130052B06RikQ3UW13 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
D130052B06RikQ3UW13 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
D130052B06RikQ3UW13 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
D130052B06RikQ3UW13 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
D130052B06RikQ3UW13 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
D130052B06RikQ3UW13 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
D130052B06RikQ3UW13 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
D130052B06RikQ3UW13 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
D130052B06RikQ3UW13 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
D130052B06RikQ3UW13 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
D130052B06RikQ3UW13 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
D130052B06RikQ3UW13 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
D130052B06RikQ3UW13 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
D130052B06RikQ3UW13 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
D130052B06RikQ3UW13 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
D130052B06RikQ3UW13 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
D130052B06RikQ3UW13 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
D130052B06RikQ3UW13 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
D130052B06RikQ3UW13 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
D130052B06RikQ3UW13 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
D130052B06RikQ3UW13 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
D130052B06RikQ3UW13 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
D130052B06RikQ3UW13 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
D130052B06RikQ3UW13 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
D130052B06RikQ3UW13 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
D130052B06RikQ3UW13 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
D130052B06RikQ3UW13 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
D130052B06RikQ3UW13 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
D130052B06RikQ3UW13 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
D130052B06RikQ3UW13 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
D130052B06RikQ3UW13 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
D130052B06RikQ3UW13 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
D130052B06RikQ3UW13 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
D130052B06RikQ3UW13 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
D130052B06RikQ3UW13 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
D130052B06RikQ3UW13 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
D130052B06RikQ3UW13 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
D130052B06RikQ3UW13 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
D130052B06RikQ3UW13 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
D130052B06RikQ3UW13 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
D130052B06RikQ3UW13 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
D130052B06RikQ3UW13 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
D130052B06RikQ3UW13 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
D130052B06RikQ3UW13 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
D130052B06RikQ3UW13 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
D130052B06RikQ3UW13 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
D130052B06RikQ3UW13 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
D130052B06RikQ3UW13 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
D130052B06RikQ3UW13 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
D130052B06RikQ3UW13 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
D130052B06RikQ3UW13 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
D130052B06RikQ3UW13 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
D130052B06RikQ3UW13 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
D130052B06RikQ3UW13 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
D130052B06RikQ3UW13 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
D130052B06RikQ3UW13 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
D130052B06RikQ3UW13 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
D130052B06RikQ3UW13 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
D130052B06RikQ3UW13 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
D130052B06RikQ3UW13 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
D130052B06RikQ3UW13 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
D130052B06RikQ3UW13 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
D130052B06RikQ3UW13 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
D130052B06RikQ3UW13 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
D130052B06RikQ3UW13 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
D130052B06RikQ3UW13 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
D130052B06RikQ3UW13 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
D130052B06RikQ3UW13 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
D130052B06RikQ3UW13 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
D130052B06RikQ3UW13 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
D130052B06RikQ3UW13 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
D130052B06RikQ3UW13 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
D130052B06RikQ3UW13 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
D130052B06RikQ3UW13 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
D130052B06RikQ3UW13 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
D130052B06RikQ3UW13 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
D130052B06RikQ3UW13 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
D130052B06RikQ3UW13 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
D130052B06RikQ3UW13 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
D130052B06RikQ3UW13 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
D130052B06RikQ3UW13 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
D130052B06RikQ3UW13 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
D130052B06RikQ3UW13 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
D130052B06RikQ3UW13 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
D130052B06RikQ3UW13 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
D130052B06RikQ3UW13 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
D130052B06RikQ3UW13 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms