Protein–RNA interactions for Protein: Q3USJ8

Fchsd2, F-BAR and double SH3 domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fchsd2Q3USJ8 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fchsd2Q3USJ8 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fchsd2Q3USJ8 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fchsd2Q3USJ8 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fchsd2Q3USJ8 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fchsd2Q3USJ8 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fchsd2Q3USJ8 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fchsd2Q3USJ8 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Fchsd2Q3USJ8 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fchsd2Q3USJ8 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Fchsd2Q3USJ8 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fchsd2Q3USJ8 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fchsd2Q3USJ8 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fchsd2Q3USJ8 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fchsd2Q3USJ8 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fchsd2Q3USJ8 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fchsd2Q3USJ8 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fchsd2Q3USJ8 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fchsd2Q3USJ8 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fchsd2Q3USJ8 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Fchsd2Q3USJ8 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fchsd2Q3USJ8 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Fchsd2Q3USJ8 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fchsd2Q3USJ8 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fchsd2Q3USJ8 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fchsd2Q3USJ8 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Fchsd2Q3USJ8 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Fchsd2Q3USJ8 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fchsd2Q3USJ8 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fchsd2Q3USJ8 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fchsd2Q3USJ8 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fchsd2Q3USJ8 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fchsd2Q3USJ8 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fchsd2Q3USJ8 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fchsd2Q3USJ8 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fchsd2Q3USJ8 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fchsd2Q3USJ8 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fchsd2Q3USJ8 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fchsd2Q3USJ8 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fchsd2Q3USJ8 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fchsd2Q3USJ8 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fchsd2Q3USJ8 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fchsd2Q3USJ8 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Fchsd2Q3USJ8 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fchsd2Q3USJ8 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fchsd2Q3USJ8 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fchsd2Q3USJ8 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fchsd2Q3USJ8 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fchsd2Q3USJ8 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fchsd2Q3USJ8 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fchsd2Q3USJ8 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fchsd2Q3USJ8 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Fchsd2Q3USJ8 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fchsd2Q3USJ8 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fchsd2Q3USJ8 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fchsd2Q3USJ8 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fchsd2Q3USJ8 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fchsd2Q3USJ8 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Fchsd2Q3USJ8 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Fchsd2Q3USJ8 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Fchsd2Q3USJ8 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fchsd2Q3USJ8 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fchsd2Q3USJ8 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fchsd2Q3USJ8 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fchsd2Q3USJ8 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fchsd2Q3USJ8 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fchsd2Q3USJ8 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fchsd2Q3USJ8 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fchsd2Q3USJ8 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fchsd2Q3USJ8 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fchsd2Q3USJ8 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fchsd2Q3USJ8 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Fchsd2Q3USJ8 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Fchsd2Q3USJ8 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Fchsd2Q3USJ8 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fchsd2Q3USJ8 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fchsd2Q3USJ8 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fchsd2Q3USJ8 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fchsd2Q3USJ8 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Fchsd2Q3USJ8 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Fchsd2Q3USJ8 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Fchsd2Q3USJ8 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fchsd2Q3USJ8 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fchsd2Q3USJ8 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fchsd2Q3USJ8 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fchsd2Q3USJ8 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fchsd2Q3USJ8 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fchsd2Q3USJ8 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fchsd2Q3USJ8 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fchsd2Q3USJ8 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Fchsd2Q3USJ8 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fchsd2Q3USJ8 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fchsd2Q3USJ8 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fchsd2Q3USJ8 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fchsd2Q3USJ8 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Fchsd2Q3USJ8 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fchsd2Q3USJ8 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fchsd2Q3USJ8 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fchsd2Q3USJ8 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fchsd2Q3USJ8 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms