Protein–RNA interactions for Protein: Q3URI6

Zfp560, Zinc finger protein 560, mousemouse

Predictions only

Length 754 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp560Q3URI6 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zfp560Q3URI6 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zfp560Q3URI6 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zfp560Q3URI6 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zfp560Q3URI6 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zfp560Q3URI6 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zfp560Q3URI6 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zfp560Q3URI6 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp560Q3URI6 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp560Q3URI6 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp560Q3URI6 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp560Q3URI6 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp560Q3URI6 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp560Q3URI6 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp560Q3URI6 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp560Q3URI6 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp560Q3URI6 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp560Q3URI6 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp560Q3URI6 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp560Q3URI6 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp560Q3URI6 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp560Q3URI6 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp560Q3URI6 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp560Q3URI6 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp560Q3URI6 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp560Q3URI6 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp560Q3URI6 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp560Q3URI6 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp560Q3URI6 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp560Q3URI6 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp560Q3URI6 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp560Q3URI6 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp560Q3URI6 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp560Q3URI6 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp560Q3URI6 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp560Q3URI6 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp560Q3URI6 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp560Q3URI6 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp560Q3URI6 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp560Q3URI6 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp560Q3URI6 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp560Q3URI6 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp560Q3URI6 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp560Q3URI6 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp560Q3URI6 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp560Q3URI6 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp560Q3URI6 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp560Q3URI6 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp560Q3URI6 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp560Q3URI6 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp560Q3URI6 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp560Q3URI6 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp560Q3URI6 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp560Q3URI6 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp560Q3URI6 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp560Q3URI6 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Zfp560Q3URI6 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zfp560Q3URI6 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zfp560Q3URI6 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zfp560Q3URI6 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zfp560Q3URI6 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zfp560Q3URI6 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zfp560Q3URI6 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp560Q3URI6 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp560Q3URI6 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp560Q3URI6 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp560Q3URI6 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp560Q3URI6 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp560Q3URI6 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp560Q3URI6 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp560Q3URI6 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp560Q3URI6 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp560Q3URI6 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp560Q3URI6 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp560Q3URI6 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp560Q3URI6 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp560Q3URI6 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp560Q3URI6 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp560Q3URI6 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp560Q3URI6 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp560Q3URI6 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp560Q3URI6 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp560Q3URI6 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp560Q3URI6 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp560Q3URI6 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp560Q3URI6 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp560Q3URI6 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp560Q3URI6 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp560Q3URI6 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp560Q3URI6 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp560Q3URI6 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp560Q3URI6 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp560Q3URI6 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp560Q3URI6 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp560Q3URI6 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp560Q3URI6 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp560Q3URI6 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp560Q3URI6 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp560Q3URI6 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp560Q3URI6 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms