Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Skap2Q3UND0 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Skap2Q3UND0 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Skap2Q3UND0 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Skap2Q3UND0 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Skap2Q3UND0 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Skap2Q3UND0 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Skap2Q3UND0 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Skap2Q3UND0 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Skap2Q3UND0 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Skap2Q3UND0 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Skap2Q3UND0 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Skap2Q3UND0 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Skap2Q3UND0 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Skap2Q3UND0 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Skap2Q3UND0 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Skap2Q3UND0 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Skap2Q3UND0 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Skap2Q3UND0 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Skap2Q3UND0 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Skap2Q3UND0 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Skap2Q3UND0 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Skap2Q3UND0 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Skap2Q3UND0 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Skap2Q3UND0 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Skap2Q3UND0 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Skap2Q3UND0 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Skap2Q3UND0 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Skap2Q3UND0 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Skap2Q3UND0 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Skap2Q3UND0 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Skap2Q3UND0 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Skap2Q3UND0 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Skap2Q3UND0 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Skap2Q3UND0 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Skap2Q3UND0 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Skap2Q3UND0 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Skap2Q3UND0 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Skap2Q3UND0 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Skap2Q3UND0 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Skap2Q3UND0 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Skap2Q3UND0 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Skap2Q3UND0 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Skap2Q3UND0 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Skap2Q3UND0 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Skap2Q3UND0 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Skap2Q3UND0 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Skap2Q3UND0 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Skap2Q3UND0 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Skap2Q3UND0 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Skap2Q3UND0 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Skap2Q3UND0 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Skap2Q3UND0 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Skap2Q3UND0 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Skap2Q3UND0 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Skap2Q3UND0 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Skap2Q3UND0 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Skap2Q3UND0 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Skap2Q3UND0 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Skap2Q3UND0 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Skap2Q3UND0 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Skap2Q3UND0 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Skap2Q3UND0 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Skap2Q3UND0 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Skap2Q3UND0 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Skap2Q3UND0 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Skap2Q3UND0 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Skap2Q3UND0 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Skap2Q3UND0 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Skap2Q3UND0 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Skap2Q3UND0 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Skap2Q3UND0 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Skap2Q3UND0 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Skap2Q3UND0 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Skap2Q3UND0 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Skap2Q3UND0 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Skap2Q3UND0 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Skap2Q3UND0 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Skap2Q3UND0 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Skap2Q3UND0 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Skap2Q3UND0 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Skap2Q3UND0 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Skap2Q3UND0 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Skap2Q3UND0 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Skap2Q3UND0 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Skap2Q3UND0 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Skap2Q3UND0 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Skap2Q3UND0 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Skap2Q3UND0 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Skap2Q3UND0 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Skap2Q3UND0 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Skap2Q3UND0 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Skap2Q3UND0 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Skap2Q3UND0 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Skap2Q3UND0 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Skap2Q3UND0 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Skap2Q3UND0 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Skap2Q3UND0 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Skap2Q3UND0 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Skap2Q3UND0 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms