Protein–RNA interactions for Protein: Q3UN04

Usp30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp30Q3UN04 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp30Q3UN04 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp30Q3UN04 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp30Q3UN04 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp30Q3UN04 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp30Q3UN04 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp30Q3UN04 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp30Q3UN04 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp30Q3UN04 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp30Q3UN04 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp30Q3UN04 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp30Q3UN04 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp30Q3UN04 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp30Q3UN04 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp30Q3UN04 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp30Q3UN04 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp30Q3UN04 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp30Q3UN04 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp30Q3UN04 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp30Q3UN04 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp30Q3UN04 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp30Q3UN04 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp30Q3UN04 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp30Q3UN04 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp30Q3UN04 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp30Q3UN04 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp30Q3UN04 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp30Q3UN04 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp30Q3UN04 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp30Q3UN04 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp30Q3UN04 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp30Q3UN04 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp30Q3UN04 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp30Q3UN04 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp30Q3UN04 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp30Q3UN04 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp30Q3UN04 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp30Q3UN04 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp30Q3UN04 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp30Q3UN04 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp30Q3UN04 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp30Q3UN04 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp30Q3UN04 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp30Q3UN04 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp30Q3UN04 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp30Q3UN04 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp30Q3UN04 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp30Q3UN04 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp30Q3UN04 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp30Q3UN04 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp30Q3UN04 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp30Q3UN04 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp30Q3UN04 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp30Q3UN04 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp30Q3UN04 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp30Q3UN04 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp30Q3UN04 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp30Q3UN04 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp30Q3UN04 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp30Q3UN04 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp30Q3UN04 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp30Q3UN04 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp30Q3UN04 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp30Q3UN04 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp30Q3UN04 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp30Q3UN04 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp30Q3UN04 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp30Q3UN04 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp30Q3UN04 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp30Q3UN04 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp30Q3UN04 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp30Q3UN04 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp30Q3UN04 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp30Q3UN04 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp30Q3UN04 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp30Q3UN04 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp30Q3UN04 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp30Q3UN04 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp30Q3UN04 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp30Q3UN04 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp30Q3UN04 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp30Q3UN04 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp30Q3UN04 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp30Q3UN04 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp30Q3UN04 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp30Q3UN04 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp30Q3UN04 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp30Q3UN04 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp30Q3UN04 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp30Q3UN04 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp30Q3UN04 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp30Q3UN04 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp30Q3UN04 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp30Q3UN04 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp30Q3UN04 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp30Q3UN04 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp30Q3UN04 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp30Q3UN04 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp30Q3UN04 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp30Q3UN04 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms