Protein–RNA interactions for Protein: Q3UM18

Lsg1, Large subunit GTPase 1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsg1Q3UM18 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lsg1Q3UM18 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lsg1Q3UM18 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Lsg1Q3UM18 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lsg1Q3UM18 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lsg1Q3UM18 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Lsg1Q3UM18 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lsg1Q3UM18 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lsg1Q3UM18 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lsg1Q3UM18 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lsg1Q3UM18 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Lsg1Q3UM18 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lsg1Q3UM18 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lsg1Q3UM18 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lsg1Q3UM18 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lsg1Q3UM18 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lsg1Q3UM18 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lsg1Q3UM18 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lsg1Q3UM18 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lsg1Q3UM18 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lsg1Q3UM18 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lsg1Q3UM18 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lsg1Q3UM18 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lsg1Q3UM18 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lsg1Q3UM18 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lsg1Q3UM18 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lsg1Q3UM18 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lsg1Q3UM18 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lsg1Q3UM18 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lsg1Q3UM18 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Lsg1Q3UM18 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lsg1Q3UM18 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Lsg1Q3UM18 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lsg1Q3UM18 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lsg1Q3UM18 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lsg1Q3UM18 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lsg1Q3UM18 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lsg1Q3UM18 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lsg1Q3UM18 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lsg1Q3UM18 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lsg1Q3UM18 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lsg1Q3UM18 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lsg1Q3UM18 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lsg1Q3UM18 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lsg1Q3UM18 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lsg1Q3UM18 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lsg1Q3UM18 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lsg1Q3UM18 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Lsg1Q3UM18 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Lsg1Q3UM18 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lsg1Q3UM18 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lsg1Q3UM18 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lsg1Q3UM18 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lsg1Q3UM18 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Lsg1Q3UM18 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Lsg1Q3UM18 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Lsg1Q3UM18 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Lsg1Q3UM18 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Lsg1Q3UM18 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lsg1Q3UM18 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lsg1Q3UM18 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lsg1Q3UM18 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lsg1Q3UM18 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lsg1Q3UM18 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lsg1Q3UM18 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lsg1Q3UM18 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Lsg1Q3UM18 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lsg1Q3UM18 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lsg1Q3UM18 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Lsg1Q3UM18 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lsg1Q3UM18 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Lsg1Q3UM18 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lsg1Q3UM18 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lsg1Q3UM18 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lsg1Q3UM18 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lsg1Q3UM18 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Lsg1Q3UM18 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lsg1Q3UM18 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lsg1Q3UM18 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lsg1Q3UM18 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lsg1Q3UM18 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lsg1Q3UM18 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lsg1Q3UM18 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lsg1Q3UM18 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Lsg1Q3UM18 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lsg1Q3UM18 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lsg1Q3UM18 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Lsg1Q3UM18 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Lsg1Q3UM18 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Lsg1Q3UM18 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Lsg1Q3UM18 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Lsg1Q3UM18 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lsg1Q3UM18 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Lsg1Q3UM18 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lsg1Q3UM18 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Lsg1Q3UM18 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lsg1Q3UM18 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lsg1Q3UM18 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lsg1Q3UM18 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lsg1Q3UM18 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms