Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW8

Parp3, Poly [ADP-ribose] polymerase, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp3Q3ULW8 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Parp3Q3ULW8 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Parp3Q3ULW8 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Parp3Q3ULW8 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Parp3Q3ULW8 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Parp3Q3ULW8 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Parp3Q3ULW8 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Parp3Q3ULW8 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Parp3Q3ULW8 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Parp3Q3ULW8 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Parp3Q3ULW8 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Parp3Q3ULW8 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Parp3Q3ULW8 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Parp3Q3ULW8 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Parp3Q3ULW8 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Parp3Q3ULW8 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Parp3Q3ULW8 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Parp3Q3ULW8 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Parp3Q3ULW8 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Parp3Q3ULW8 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Parp3Q3ULW8 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Parp3Q3ULW8 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Parp3Q3ULW8 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Parp3Q3ULW8 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Parp3Q3ULW8 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Parp3Q3ULW8 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Parp3Q3ULW8 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Parp3Q3ULW8 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Parp3Q3ULW8 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Parp3Q3ULW8 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Parp3Q3ULW8 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Parp3Q3ULW8 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Parp3Q3ULW8 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Parp3Q3ULW8 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Parp3Q3ULW8 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Parp3Q3ULW8 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Parp3Q3ULW8 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Parp3Q3ULW8 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Parp3Q3ULW8 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Parp3Q3ULW8 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Parp3Q3ULW8 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Parp3Q3ULW8 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Parp3Q3ULW8 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Parp3Q3ULW8 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Parp3Q3ULW8 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Parp3Q3ULW8 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Parp3Q3ULW8 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Parp3Q3ULW8 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Parp3Q3ULW8 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Parp3Q3ULW8 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Parp3Q3ULW8 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Parp3Q3ULW8 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Parp3Q3ULW8 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Parp3Q3ULW8 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Parp3Q3ULW8 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Parp3Q3ULW8 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Parp3Q3ULW8 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Parp3Q3ULW8 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Parp3Q3ULW8 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Parp3Q3ULW8 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Parp3Q3ULW8 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Parp3Q3ULW8 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Parp3Q3ULW8 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Parp3Q3ULW8 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Parp3Q3ULW8 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Parp3Q3ULW8 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Parp3Q3ULW8 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Parp3Q3ULW8 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Parp3Q3ULW8 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Parp3Q3ULW8 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Parp3Q3ULW8 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Parp3Q3ULW8 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Parp3Q3ULW8 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Parp3Q3ULW8 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Parp3Q3ULW8 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Parp3Q3ULW8 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Parp3Q3ULW8 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Parp3Q3ULW8 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Parp3Q3ULW8 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Parp3Q3ULW8 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Parp3Q3ULW8 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Parp3Q3ULW8 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Parp3Q3ULW8 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Parp3Q3ULW8 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Parp3Q3ULW8 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Parp3Q3ULW8 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Parp3Q3ULW8 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Parp3Q3ULW8 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Parp3Q3ULW8 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Parp3Q3ULW8 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Parp3Q3ULW8 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Parp3Q3ULW8 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Parp3Q3ULW8 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Parp3Q3ULW8 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Parp3Q3ULW8 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Parp3Q3ULW8 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Parp3Q3ULW8 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Parp3Q3ULW8 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Parp3Q3ULW8 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Parp3Q3ULW8 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms