Protein–RNA interactions for Protein: Q3UK78

Pcgf5, Polycomb group RING finger protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcgf5Q3UK78 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcgf5Q3UK78 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcgf5Q3UK78 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcgf5Q3UK78 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcgf5Q3UK78 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcgf5Q3UK78 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcgf5Q3UK78 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcgf5Q3UK78 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcgf5Q3UK78 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcgf5Q3UK78 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcgf5Q3UK78 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcgf5Q3UK78 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcgf5Q3UK78 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcgf5Q3UK78 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcgf5Q3UK78 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcgf5Q3UK78 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcgf5Q3UK78 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcgf5Q3UK78 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcgf5Q3UK78 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcgf5Q3UK78 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcgf5Q3UK78 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcgf5Q3UK78 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcgf5Q3UK78 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcgf5Q3UK78 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcgf5Q3UK78 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcgf5Q3UK78 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcgf5Q3UK78 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcgf5Q3UK78 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcgf5Q3UK78 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcgf5Q3UK78 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcgf5Q3UK78 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcgf5Q3UK78 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcgf5Q3UK78 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcgf5Q3UK78 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcgf5Q3UK78 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcgf5Q3UK78 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcgf5Q3UK78 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcgf5Q3UK78 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcgf5Q3UK78 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcgf5Q3UK78 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcgf5Q3UK78 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcgf5Q3UK78 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcgf5Q3UK78 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcgf5Q3UK78 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcgf5Q3UK78 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcgf5Q3UK78 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcgf5Q3UK78 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcgf5Q3UK78 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcgf5Q3UK78 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcgf5Q3UK78 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcgf5Q3UK78 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcgf5Q3UK78 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcgf5Q3UK78 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcgf5Q3UK78 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcgf5Q3UK78 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcgf5Q3UK78 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcgf5Q3UK78 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcgf5Q3UK78 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcgf5Q3UK78 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcgf5Q3UK78 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcgf5Q3UK78 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcgf5Q3UK78 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcgf5Q3UK78 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcgf5Q3UK78 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcgf5Q3UK78 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcgf5Q3UK78 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcgf5Q3UK78 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcgf5Q3UK78 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcgf5Q3UK78 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcgf5Q3UK78 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcgf5Q3UK78 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcgf5Q3UK78 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcgf5Q3UK78 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pcgf5Q3UK78 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pcgf5Q3UK78 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pcgf5Q3UK78 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pcgf5Q3UK78 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pcgf5Q3UK78 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pcgf5Q3UK78 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pcgf5Q3UK78 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pcgf5Q3UK78 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pcgf5Q3UK78 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pcgf5Q3UK78 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pcgf5Q3UK78 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pcgf5Q3UK78 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pcgf5Q3UK78 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pcgf5Q3UK78 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pcgf5Q3UK78 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pcgf5Q3UK78 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pcgf5Q3UK78 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pcgf5Q3UK78 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pcgf5Q3UK78 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pcgf5Q3UK78 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pcgf5Q3UK78 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pcgf5Q3UK78 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pcgf5Q3UK78 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pcgf5Q3UK78 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pcgf5Q3UK78 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pcgf5Q3UK78 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pcgf5Q3UK78 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms