Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJU9

Rmdn3, Regulator of microtubule dynamics protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rmdn3Q3UJU9 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rmdn3Q3UJU9 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rmdn3Q3UJU9 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rmdn3Q3UJU9 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rmdn3Q3UJU9 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rmdn3Q3UJU9 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rmdn3Q3UJU9 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rmdn3Q3UJU9 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rmdn3Q3UJU9 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rmdn3Q3UJU9 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rmdn3Q3UJU9 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rmdn3Q3UJU9 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rmdn3Q3UJU9 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rmdn3Q3UJU9 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rmdn3Q3UJU9 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rmdn3Q3UJU9 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rmdn3Q3UJU9 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rmdn3Q3UJU9 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rmdn3Q3UJU9 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rmdn3Q3UJU9 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rmdn3Q3UJU9 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rmdn3Q3UJU9 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rmdn3Q3UJU9 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rmdn3Q3UJU9 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rmdn3Q3UJU9 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rmdn3Q3UJU9 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rmdn3Q3UJU9 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rmdn3Q3UJU9 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rmdn3Q3UJU9 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rmdn3Q3UJU9 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rmdn3Q3UJU9 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rmdn3Q3UJU9 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rmdn3Q3UJU9 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rmdn3Q3UJU9 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rmdn3Q3UJU9 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rmdn3Q3UJU9 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rmdn3Q3UJU9 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rmdn3Q3UJU9 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rmdn3Q3UJU9 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rmdn3Q3UJU9 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rmdn3Q3UJU9 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rmdn3Q3UJU9 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rmdn3Q3UJU9 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rmdn3Q3UJU9 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rmdn3Q3UJU9 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rmdn3Q3UJU9 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rmdn3Q3UJU9 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rmdn3Q3UJU9 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rmdn3Q3UJU9 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rmdn3Q3UJU9 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rmdn3Q3UJU9 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rmdn3Q3UJU9 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rmdn3Q3UJU9 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rmdn3Q3UJU9 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rmdn3Q3UJU9 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rmdn3Q3UJU9 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rmdn3Q3UJU9 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rmdn3Q3UJU9 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rmdn3Q3UJU9 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rmdn3Q3UJU9 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rmdn3Q3UJU9 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rmdn3Q3UJU9 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rmdn3Q3UJU9 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rmdn3Q3UJU9 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rmdn3Q3UJU9 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rmdn3Q3UJU9 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rmdn3Q3UJU9 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rmdn3Q3UJU9 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rmdn3Q3UJU9 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rmdn3Q3UJU9 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rmdn3Q3UJU9 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rmdn3Q3UJU9 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rmdn3Q3UJU9 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rmdn3Q3UJU9 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rmdn3Q3UJU9 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rmdn3Q3UJU9 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rmdn3Q3UJU9 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rmdn3Q3UJU9 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rmdn3Q3UJU9 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rmdn3Q3UJU9 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rmdn3Q3UJU9 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rmdn3Q3UJU9 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rmdn3Q3UJU9 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rmdn3Q3UJU9 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rmdn3Q3UJU9 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rmdn3Q3UJU9 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rmdn3Q3UJU9 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rmdn3Q3UJU9 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rmdn3Q3UJU9 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rmdn3Q3UJU9 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rmdn3Q3UJU9 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rmdn3Q3UJU9 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rmdn3Q3UJU9 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rmdn3Q3UJU9 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rmdn3Q3UJU9 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rmdn3Q3UJU9 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rmdn3Q3UJU9 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rmdn3Q3UJU9 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rmdn3Q3UJU9 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rmdn3Q3UJU9 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms