Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc34Q3UI66 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc34Q3UI66 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc34Q3UI66 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc34Q3UI66 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc34Q3UI66 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc34Q3UI66 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc34Q3UI66 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc34Q3UI66 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc34Q3UI66 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc34Q3UI66 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc34Q3UI66 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc34Q3UI66 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc34Q3UI66 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc34Q3UI66 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc34Q3UI66 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc34Q3UI66 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc34Q3UI66 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc34Q3UI66 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc34Q3UI66 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc34Q3UI66 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc34Q3UI66 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc34Q3UI66 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc34Q3UI66 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc34Q3UI66 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc34Q3UI66 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc34Q3UI66 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc34Q3UI66 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc34Q3UI66 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc34Q3UI66 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc34Q3UI66 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc34Q3UI66 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc34Q3UI66 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc34Q3UI66 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc34Q3UI66 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc34Q3UI66 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc34Q3UI66 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc34Q3UI66 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc34Q3UI66 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc34Q3UI66 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc34Q3UI66 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc34Q3UI66 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc34Q3UI66 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc34Q3UI66 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc34Q3UI66 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc34Q3UI66 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc34Q3UI66 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc34Q3UI66 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc34Q3UI66 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc34Q3UI66 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc34Q3UI66 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc34Q3UI66 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc34Q3UI66 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc34Q3UI66 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc34Q3UI66 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc34Q3UI66 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc34Q3UI66 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc34Q3UI66 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc34Q3UI66 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc34Q3UI66 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc34Q3UI66 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc34Q3UI66 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc34Q3UI66 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc34Q3UI66 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc34Q3UI66 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc34Q3UI66 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc34Q3UI66 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc34Q3UI66 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc34Q3UI66 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc34Q3UI66 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc34Q3UI66 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc34Q3UI66 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc34Q3UI66 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc34Q3UI66 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc34Q3UI66 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc34Q3UI66 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc34Q3UI66 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc34Q3UI66 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc34Q3UI66 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc34Q3UI66 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc34Q3UI66 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc34Q3UI66 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc34Q3UI66 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc34Q3UI66 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc34Q3UI66 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc34Q3UI66 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc34Q3UI66 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc34Q3UI66 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc34Q3UI66 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc34Q3UI66 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc34Q3UI66 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc34Q3UI66 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc34Q3UI66 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc34Q3UI66 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc34Q3UI66 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc34Q3UI66 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc34Q3UI66 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc34Q3UI66 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc34Q3UI66 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc34Q3UI66 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.8 ms