Protein–RNA interactions for Protein: Q3UA06

Trip13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip13Q3UA06 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trip13Q3UA06 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trip13Q3UA06 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trip13Q3UA06 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trip13Q3UA06 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trip13Q3UA06 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trip13Q3UA06 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trip13Q3UA06 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trip13Q3UA06 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trip13Q3UA06 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trip13Q3UA06 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trip13Q3UA06 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trip13Q3UA06 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trip13Q3UA06 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trip13Q3UA06 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trip13Q3UA06 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trip13Q3UA06 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trip13Q3UA06 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Trip13Q3UA06 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trip13Q3UA06 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trip13Q3UA06 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trip13Q3UA06 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Trip13Q3UA06 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trip13Q3UA06 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trip13Q3UA06 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trip13Q3UA06 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trip13Q3UA06 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trip13Q3UA06 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trip13Q3UA06 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trip13Q3UA06 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trip13Q3UA06 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trip13Q3UA06 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trip13Q3UA06 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trip13Q3UA06 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trip13Q3UA06 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trip13Q3UA06 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trip13Q3UA06 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trip13Q3UA06 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trip13Q3UA06 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trip13Q3UA06 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trip13Q3UA06 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trip13Q3UA06 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trip13Q3UA06 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trip13Q3UA06 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trip13Q3UA06 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trip13Q3UA06 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trip13Q3UA06 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trip13Q3UA06 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Trip13Q3UA06 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trip13Q3UA06 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trip13Q3UA06 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Trip13Q3UA06 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trip13Q3UA06 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trip13Q3UA06 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trip13Q3UA06 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Trip13Q3UA06 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trip13Q3UA06 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trip13Q3UA06 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trip13Q3UA06 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trip13Q3UA06 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trip13Q3UA06 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trip13Q3UA06 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trip13Q3UA06 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trip13Q3UA06 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trip13Q3UA06 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trip13Q3UA06 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trip13Q3UA06 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trip13Q3UA06 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trip13Q3UA06 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trip13Q3UA06 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trip13Q3UA06 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trip13Q3UA06 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trip13Q3UA06 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trip13Q3UA06 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trip13Q3UA06 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trip13Q3UA06 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trip13Q3UA06 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trip13Q3UA06 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trip13Q3UA06 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trip13Q3UA06 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trip13Q3UA06 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trip13Q3UA06 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trip13Q3UA06 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trip13Q3UA06 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trip13Q3UA06 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trip13Q3UA06 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trip13Q3UA06 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trip13Q3UA06 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Trip13Q3UA06 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trip13Q3UA06 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trip13Q3UA06 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trip13Q3UA06 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trip13Q3UA06 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trip13Q3UA06 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trip13Q3UA06 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trip13Q3UA06 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trip13Q3UA06 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trip13Q3UA06 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trip13Q3UA06 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trip13Q3UA06 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms