Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms