Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ulk3Q3U3Q1 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ulk3Q3U3Q1 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ulk3Q3U3Q1 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ulk3Q3U3Q1 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ulk3Q3U3Q1 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ulk3Q3U3Q1 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Ulk3Q3U3Q1 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Ulk3Q3U3Q1 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ulk3Q3U3Q1 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ulk3Q3U3Q1 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ulk3Q3U3Q1 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ulk3Q3U3Q1 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ulk3Q3U3Q1 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ulk3Q3U3Q1 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ulk3Q3U3Q1 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ulk3Q3U3Q1 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ulk3Q3U3Q1 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ulk3Q3U3Q1 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ulk3Q3U3Q1 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ulk3Q3U3Q1 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ulk3Q3U3Q1 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ulk3Q3U3Q1 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ulk3Q3U3Q1 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ulk3Q3U3Q1 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ulk3Q3U3Q1 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ulk3Q3U3Q1 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ulk3Q3U3Q1 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ulk3Q3U3Q1 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ulk3Q3U3Q1 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ulk3Q3U3Q1 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ulk3Q3U3Q1 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ulk3Q3U3Q1 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ulk3Q3U3Q1 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ulk3Q3U3Q1 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ulk3Q3U3Q1 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ulk3Q3U3Q1 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ulk3Q3U3Q1 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ulk3Q3U3Q1 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ulk3Q3U3Q1 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ulk3Q3U3Q1 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ulk3Q3U3Q1 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ulk3Q3U3Q1 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ulk3Q3U3Q1 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ulk3Q3U3Q1 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ulk3Q3U3Q1 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ulk3Q3U3Q1 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ulk3Q3U3Q1 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ulk3Q3U3Q1 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ulk3Q3U3Q1 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ulk3Q3U3Q1 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ulk3Q3U3Q1 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ulk3Q3U3Q1 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ulk3Q3U3Q1 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ulk3Q3U3Q1 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ulk3Q3U3Q1 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ulk3Q3U3Q1 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ulk3Q3U3Q1 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ulk3Q3U3Q1 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ulk3Q3U3Q1 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ulk3Q3U3Q1 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ulk3Q3U3Q1 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ulk3Q3U3Q1 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ulk3Q3U3Q1 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ulk3Q3U3Q1 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ulk3Q3U3Q1 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ulk3Q3U3Q1 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ulk3Q3U3Q1 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ulk3Q3U3Q1 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ulk3Q3U3Q1 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ulk3Q3U3Q1 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ulk3Q3U3Q1 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ulk3Q3U3Q1 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ulk3Q3U3Q1 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ulk3Q3U3Q1 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ulk3Q3U3Q1 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ulk3Q3U3Q1 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ulk3Q3U3Q1 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ulk3Q3U3Q1 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ulk3Q3U3Q1 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ulk3Q3U3Q1 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ulk3Q3U3Q1 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ulk3Q3U3Q1 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ulk3Q3U3Q1 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ulk3Q3U3Q1 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ulk3Q3U3Q1 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ulk3Q3U3Q1 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ulk3Q3U3Q1 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ulk3Q3U3Q1 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ulk3Q3U3Q1 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ulk3Q3U3Q1 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ulk3Q3U3Q1 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ulk3Q3U3Q1 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ulk3Q3U3Q1 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ulk3Q3U3Q1 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ulk3Q3U3Q1 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ulk3Q3U3Q1 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ulk3Q3U3Q1 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ulk3Q3U3Q1 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ulk3Q3U3Q1 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms