Protein–RNA interactions for Protein: Q3U285

Lcorl, Ligand-dependent nuclear receptor corepressor-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LcorlQ3U285 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LcorlQ3U285 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LcorlQ3U285 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LcorlQ3U285 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LcorlQ3U285 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LcorlQ3U285 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LcorlQ3U285 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LcorlQ3U285 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LcorlQ3U285 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LcorlQ3U285 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LcorlQ3U285 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
LcorlQ3U285 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LcorlQ3U285 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LcorlQ3U285 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LcorlQ3U285 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LcorlQ3U285 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LcorlQ3U285 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LcorlQ3U285 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LcorlQ3U285 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LcorlQ3U285 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LcorlQ3U285 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LcorlQ3U285 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LcorlQ3U285 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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LcorlQ3U285 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LcorlQ3U285 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LcorlQ3U285 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
LcorlQ3U285 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LcorlQ3U285 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LcorlQ3U285 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LcorlQ3U285 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LcorlQ3U285 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LcorlQ3U285 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LcorlQ3U285 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LcorlQ3U285 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LcorlQ3U285 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LcorlQ3U285 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LcorlQ3U285 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LcorlQ3U285 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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LcorlQ3U285 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LcorlQ3U285 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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LcorlQ3U285 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LcorlQ3U285 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LcorlQ3U285 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LcorlQ3U285 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LcorlQ3U285 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LcorlQ3U285 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LcorlQ3U285 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LcorlQ3U285 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LcorlQ3U285 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LcorlQ3U285 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LcorlQ3U285 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LcorlQ3U285 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LcorlQ3U285 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LcorlQ3U285 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LcorlQ3U285 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LcorlQ3U285 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LcorlQ3U285 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LcorlQ3U285 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LcorlQ3U285 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LcorlQ3U285 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LcorlQ3U285 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LcorlQ3U285 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LcorlQ3U285 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LcorlQ3U285 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LcorlQ3U285 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LcorlQ3U285 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LcorlQ3U285 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
LcorlQ3U285 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LcorlQ3U285 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LcorlQ3U285 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LcorlQ3U285 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LcorlQ3U285 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LcorlQ3U285 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
LcorlQ3U285 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LcorlQ3U285 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LcorlQ3U285 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LcorlQ3U285 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LcorlQ3U285 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LcorlQ3U285 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LcorlQ3U285 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LcorlQ3U285 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LcorlQ3U285 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LcorlQ3U285 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LcorlQ3U285 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LcorlQ3U285 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LcorlQ3U285 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LcorlQ3U285 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LcorlQ3U285 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LcorlQ3U285 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LcorlQ3U285 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LcorlQ3U285 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LcorlQ3U285 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LcorlQ3U285 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LcorlQ3U285 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms