Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1F9

Pag1, Phosphoprotein associated with glycosphingolipid-enriched microdomains 1, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pag1Q3U1F9 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pag1Q3U1F9 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pag1Q3U1F9 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pag1Q3U1F9 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pag1Q3U1F9 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pag1Q3U1F9 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pag1Q3U1F9 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pag1Q3U1F9 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pag1Q3U1F9 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pag1Q3U1F9 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pag1Q3U1F9 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pag1Q3U1F9 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pag1Q3U1F9 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pag1Q3U1F9 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pag1Q3U1F9 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pag1Q3U1F9 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pag1Q3U1F9 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pag1Q3U1F9 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pag1Q3U1F9 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pag1Q3U1F9 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pag1Q3U1F9 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pag1Q3U1F9 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pag1Q3U1F9 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pag1Q3U1F9 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pag1Q3U1F9 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pag1Q3U1F9 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pag1Q3U1F9 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pag1Q3U1F9 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pag1Q3U1F9 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pag1Q3U1F9 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pag1Q3U1F9 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pag1Q3U1F9 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pag1Q3U1F9 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pag1Q3U1F9 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pag1Q3U1F9 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pag1Q3U1F9 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pag1Q3U1F9 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pag1Q3U1F9 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pag1Q3U1F9 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pag1Q3U1F9 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pag1Q3U1F9 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pag1Q3U1F9 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pag1Q3U1F9 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pag1Q3U1F9 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pag1Q3U1F9 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pag1Q3U1F9 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pag1Q3U1F9 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pag1Q3U1F9 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pag1Q3U1F9 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pag1Q3U1F9 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pag1Q3U1F9 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pag1Q3U1F9 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pag1Q3U1F9 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pag1Q3U1F9 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pag1Q3U1F9 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pag1Q3U1F9 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Pag1Q3U1F9 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pag1Q3U1F9 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pag1Q3U1F9 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pag1Q3U1F9 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pag1Q3U1F9 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pag1Q3U1F9 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pag1Q3U1F9 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pag1Q3U1F9 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pag1Q3U1F9 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pag1Q3U1F9 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Pag1Q3U1F9 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pag1Q3U1F9 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pag1Q3U1F9 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pag1Q3U1F9 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pag1Q3U1F9 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pag1Q3U1F9 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pag1Q3U1F9 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pag1Q3U1F9 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pag1Q3U1F9 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pag1Q3U1F9 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pag1Q3U1F9 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pag1Q3U1F9 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pag1Q3U1F9 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pag1Q3U1F9 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pag1Q3U1F9 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pag1Q3U1F9 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pag1Q3U1F9 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pag1Q3U1F9 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pag1Q3U1F9 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pag1Q3U1F9 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pag1Q3U1F9 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pag1Q3U1F9 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pag1Q3U1F9 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pag1Q3U1F9 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pag1Q3U1F9 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pag1Q3U1F9 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pag1Q3U1F9 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pag1Q3U1F9 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pag1Q3U1F9 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pag1Q3U1F9 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pag1Q3U1F9 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pag1Q3U1F9 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pag1Q3U1F9 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pag1Q3U1F9 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms