Protein–RNA interactions for Protein: Q3U155

Ccdc174, Coiled-coil domain-containing protein 174, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc174Q3U155 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc174Q3U155 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc174Q3U155 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc174Q3U155 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc174Q3U155 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc174Q3U155 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc174Q3U155 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc174Q3U155 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc174Q3U155 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc174Q3U155 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc174Q3U155 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc174Q3U155 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc174Q3U155 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc174Q3U155 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc174Q3U155 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc174Q3U155 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc174Q3U155 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc174Q3U155 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc174Q3U155 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc174Q3U155 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc174Q3U155 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc174Q3U155 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc174Q3U155 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc174Q3U155 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc174Q3U155 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc174Q3U155 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc174Q3U155 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc174Q3U155 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc174Q3U155 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc174Q3U155 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc174Q3U155 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc174Q3U155 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc174Q3U155 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc174Q3U155 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc174Q3U155 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc174Q3U155 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc174Q3U155 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc174Q3U155 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc174Q3U155 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc174Q3U155 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc174Q3U155 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc174Q3U155 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc174Q3U155 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc174Q3U155 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc174Q3U155 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc174Q3U155 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc174Q3U155 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc174Q3U155 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc174Q3U155 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc174Q3U155 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc174Q3U155 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc174Q3U155 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc174Q3U155 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc174Q3U155 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc174Q3U155 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc174Q3U155 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc174Q3U155 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc174Q3U155 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc174Q3U155 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc174Q3U155 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc174Q3U155 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc174Q3U155 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc174Q3U155 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc174Q3U155 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc174Q3U155 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc174Q3U155 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc174Q3U155 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc174Q3U155 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc174Q3U155 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc174Q3U155 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc174Q3U155 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc174Q3U155 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc174Q3U155 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc174Q3U155 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc174Q3U155 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc174Q3U155 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc174Q3U155 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc174Q3U155 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc174Q3U155 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc174Q3U155 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc174Q3U155 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc174Q3U155 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc174Q3U155 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc174Q3U155 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc174Q3U155 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc174Q3U155 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc174Q3U155 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc174Q3U155 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc174Q3U155 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc174Q3U155 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc174Q3U155 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc174Q3U155 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc174Q3U155 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc174Q3U155 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc174Q3U155 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc174Q3U155 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc174Q3U155 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc174Q3U155 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc174Q3U155 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc174Q3U155 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms